RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 ODC1P11926 461 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 SELENONQ9NZV5 590 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 ETFBP38117 255 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 C10orf120Q5SQS8 335 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM69Q86WT6 500 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 WDR49Q8IV35 697 aa21.88■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 DEPDC1Q5TB30 811 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 ADCK2Q7Z695 626 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 ACER1Q8TDN7 264 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 FAM172AQ8WUF8 416 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 APOL5Q9BWW9 433 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 PRRG1O14668 218 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB22O15209 634 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 MICU2Q8IYU8 434 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 TUBGCP3Q96CW5 907 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 HIC2Q96JB3 615 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 KCTD10Q9H3F6 313 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 SHOC2Q9UQ13 582 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 VWA5AO00534 786 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 BCAT1P54687 386 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 SEZ6Q53EL9 994 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 C2CD6Q53TS8 623 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 SLFN11Q7Z7L1 901 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 MTMR8Q96EF0 704 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 PCDH9Q9HC56 1237 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 ITM2BQ9Y287 266 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 ARIH2O95376 493 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 PPP3CCP48454 512 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 CPT1AP50416 773 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 ZCWPW2Q504Y3 356 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 RAET1EQ8TD07 263 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 SLC20A1Q8WUM9 679 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 TAGLN3Q9UI15 199 aa21.87■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 WASHC5Q12768 1159 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 SEL1L3Q68CR1 1132 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM121Q9BTD3 319 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 BRD8Q9H0E9 1235 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 USP18Q9UMW8 372 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 PIK3CDO00329 1044 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 AP1G2O75843 785 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 SERPIND1P05546 499 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 GHRP10912 638 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 ACO1P21399 889 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 PCNX4Q63HM2 1172 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 SV2AQ7L0J3 742 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 SLC47A2Q86VL8 602 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 RXFP1Q9HBX9 757 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 MPP6Q9NZW5 540 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 CRLS1Q9UJA2 301 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 C2orf81A6NN90 581 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 PGK2P07205 417 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 VCAM1P19320 739 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 OR1G1P47890 313 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 ACOT1Q86TX2 421 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 YAF2Q8IY57 180 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA0895Q8NCT3 520 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 AP4S1Q9Y587 144 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 PTPN4P29074 926 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 SOX11P35716 441 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 AQP5P55064 265 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM60Q495X7 471 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 VPS50Q96JG6 964 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 TMX2Q9Y320 296 aa21.86■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 CRYMQ14894 314 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 USP1O94782 785 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 CETPP11597 493 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 ATP6V1B1P15313 513 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 SGO1Q5FBB7 561 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 CACHD1Q5VU97 1274 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 JADE3Q92613 823 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 CISHQ9NSE2 258 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 FKBP6O75344 327 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 PMS1P54277 932 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 NUP107P57740 925 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 ABRAQ8N0Z2 381 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 PHF21AQ96BD5 680 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms