RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261726.10

CUX2-201, Transcript of cut like homeobox 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX2, Length 6,844 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2-201ENST00000261726 CYP4Z1Q86W10 505 aa14.78□□□□□ -0.04
CUX2-201ENST00000261726 DDHD1Q8NEL9 900 aa14.78□□□□□ -0.04
CUX2-201ENST00000261726 PIK3R5Q8WYR1 880 aa14.78□□□□□ -0.04
CUX2-201ENST00000261726 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa14.78□□□□□ -0.04
CUX2-201ENST00000261726 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CUX2-201ENST00000261726 RCN1Q15293 331 aa14.77□□□□□ -0.04
CUX2-201ENST00000261726 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
CUX2-201ENST00000261726 CARD9Q9H257 536 aa14.77□□□□□ -0.04
CUX2-201ENST00000261726 DYRK1BQ9Y463 629 aa14.77□□□□□ -0.04
CUX2-201ENST00000261726 ODC1P11926 461 aa14.77□□□□□ -0.04
CUX2-201ENST00000261726 SEC24CP53992 1094 aa14.77□□□□□ -0.04
CUX2-201ENST00000261726 NFYCQ13952 458 aa14.77□□□□□ -0.04
CUX2-201ENST00000261726 NOTUMQ6P988 496 aa14.77□□□□□ -0.04
CUX2-201ENST00000261726 MIB1Q86YT6 1006 aa14.77□□□□□ -0.04
CUX2-201ENST00000261726 KLHL31Q9H511 634 aa14.77□□□□□ -0.04
CUX2-201ENST00000261726 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
CUX2-201ENST00000261726 SPATA2Q9UM82 520 aa14.77□□□□□ -0.04
CUX2-201ENST00000261726 RFC5P40937 340 aa14.77□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 DGKDQ16760 1214 aa14.77□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 C19orf18Q8NEA5 215 aa14.77□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 ATP6V1HQ9UI12 483 aa14.77□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 MGAT4DA6NG13 374 aa14.77□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 F5H5T6 163 aa14.77□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 VHLP40337 213 aa14.77□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 MMRN1Q13201 1228 aa14.77□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 SLC44A4Q53GD3 710 aa14.77□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 ARMCX4Q5H9R4 360 aa14.77□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 DGKKQ5KSL6 1271 aa14.77□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 C12orf60Q5U649 245 aa14.77□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 TLK2Q86UE8 772 aa14.77□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 GINS4Q9BRT9 223 aa14.77□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 MRGBPQ9NV56 204 aa14.77□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 KLHL20Q9Y2M5 609 aa14.77□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa14.77□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 MAPK9P45984 424 aa14.77□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 DPYDQ12882 1025 aa14.77□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 SLC29A2Q14542 456 aa14.77□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa14.77□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 C19orf60Q96EN9 201 aa14.77□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 KLHL25Q9H0H3 589 aa14.77□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 DPP3Q9NY33 737 aa14.77□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa14.77□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 WEE1P30291 646 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 COILP38432 576 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 CENPCQ03188 943 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 CHRNB3Q05901 458 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 TRAF2Q12933 501 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 C7orf25Q9BPX7 421 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 OSBPL6Q9BZF3 934 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 PPCSQ9HAB8 311 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 TRPC4Q9UBN4 977 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 CCT8L1PA6NM43 557 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 NR3C2P08235 984 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 C4BPBP20851 252 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 STX5Q13190 355 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 MYO1HQ8N1T3 1032 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 NACC2Q96BF6 587 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 A0A0G2JLW4 131 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 GEMP55040 296 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 MRNIPQ6NTE8 343 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 NIF3L1Q9GZT8 377 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 NDUFB10O96000 172 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 ITGAXP20702 1163 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 ALDH9A1P49189 494 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 TAF6P49848 677 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 NEK10Q6ZWH5 1172 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 SMIM5Q71RC9 77 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 CAMKK2Q96RR4 588 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 VTA1Q9NP79 307 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 ALG6Q9Y672 507 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 TRIM66O15016 1216 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 DSG3P32926 999 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 THPOP40225 353 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 HSPA13P48723 471 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 ZNF543Q08ER8 600 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 GNASQ5JWF2 1037 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 SP8Q8IXZ3 490 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 MKL2Q9ULH7 1088 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa14.76□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 A0A1B0GTH6 734 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 TBC1D12O60347 775 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 VCLP18206 1134 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 KRT20P35900 424 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 ALX1Q15699 326 aa14.75□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 GSTA3Q16772 222 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms