RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa16.6■□□□□ 0.25
CTIF-201ENST00000256413 CDRT15Q96T59 188 aa16.6■□□□□ 0.25
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CTIF-201ENST00000256413 S100A9P06702 114 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
CTIF-201ENST00000256413 SLC1A6P48664 564 aa16.6■□□□□ 0.25
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CTIF-201ENST00000256413 LIN52Q52LA3 116 aa16.6■□□□□ 0.25
CTIF-201ENST00000256413 KLHL17Q6TDP4 642 aa16.6■□□□□ 0.25
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CTIF-201ENST00000256413 DENND1BQ6P3S1 775 aa16.6■□□□□ 0.25
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CTIF-201ENST00000256413 ZNF398Q8TD17 642 aa16.6■□□□□ 0.25
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CTIF-201ENST00000256413 AGKQ53H12 422 aa16.59■□□□□ 0.25
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CTIF-201ENST00000256413 C5orf58C9J3I9 102 aa16.59■□□□□ 0.25
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CTIF-201ENST00000256413 HES6Q96HZ4 224 aa16.58■□□□□ 0.25
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CTIF-201ENST00000256413 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa16.58■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 TMEM179Q6ZVK1 233 aa16.58■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 POC5Q8NA72 575 aa16.58■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 SP110Q9HB58 689 aa16.58■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 CROTQ9UKG9 612 aa16.58■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 TPRKBQ9Y3C4 175 aa16.58■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa16.58■□□□□ 0.24
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