RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 CBWD3Q5JTY5 395 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-201ENST00000246533 CBWD5Q5RIA9 395 aa27.7■■■□□ 2.02
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CAPNS1-201ENST00000246533 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-201ENST00000246533 ART4Q93070 314 aa27.7■■■□□ 2.02
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CAPNS1-201ENST00000246533 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
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CAPNS1-201ENST00000246533 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-201ENST00000246533 CD101Q93033 1021 aa27.65■■■□□ 2.02
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