RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006015.3

HOXA11-201, Transcript of homeobox A11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA11, Length 2,295 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11-201ENST00000006015 RHPN2Q8IUC4 686 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 TRIM42Q8IWZ5 723 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 FBXO36Q8NEA4 188 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 LZICQ8WZA0 190 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 VCPIP1Q96JH7 1222 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 C7orf26Q96N11 449 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 C1orf21Q9H246 121 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 C17orf75Q9HAS0 396 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 C1orf112Q9NSG2 853 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 E7ESA3 106 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 TMCC1O94876 653 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 STIP1P31948 543 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 ITGA9Q13797 1035 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 FNBP1LQ5T0N5 605 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 FAM102BQ5T8I3 360 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 ARHGEF16Q5VV41 709 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 PALM2Q8IXS6 379 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 PDCD2LQ9BRP1 358 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 VPS33BQ9H267 617 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 S100A14Q9HCY8 104 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 CIDEBQ9UHD4 219 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 IP6K2Q9UHH9 426 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 EXOC7Q9UPT5 735 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 E5RJQ4 531 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 KDSRQ06136 332 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 CDK18Q07002 472 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 PTK7Q13308 1070 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 MSS51Q4VC12 460 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 TMEM121Q9BTD3 319 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 PXMP2Q9NR77 195 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 A6NJR5 290 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 VWA5AO00534 786 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 PIAS1O75925 651 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 RGS2P41220 211 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 GRIA2P42262 883 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 SP4Q02446 784 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 XKR9Q5GH70 373 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 SV2AQ7L0J3 742 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 SERAC1Q96JX3 654 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 SENP7Q9BQF6 1050 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 ETNK2Q9NVF9 386 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 PTTG2Q9NZH5 202 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 PPME1Q9Y570 386 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 IKBKGQ9Y6K9 419 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 ITGA2BP08514 1039 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 FAM200BP0CF97 657 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 DSG3P32926 999 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 CCNFP41002 786 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 ERFP50548 548 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 NCKAP1LP55160 1127 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 USP46P62068 366 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 NOMO3P69849 1222 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 MDH1BQ5I0G3 518 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 LRRC38Q5VT99 294 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 NIPA1Q7RTP0 329 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 NAT8LQ8N9F0 302 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 FEZF2Q8TBJ5 459 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 CPT1BQ92523 772 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 TBC1D22BQ9NU19 505 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 PLCB3Q01970 1234 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 GAD2Q05329 585 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 TNFAIP1Q13829 316 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 ANKRD22Q5VYY1 191 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 SH2D5Q6ZV89 423 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 HAUS1Q96CS2 278 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 MFSD14AQ96MC6 490 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 CCDC106Q9BWC9 280 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 KLHL4Q9C0H6 718 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 GINM1Q9NU53 330 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 HIC1Q14526 733 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 EFHC1Q5JVL4 640 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 ATG16L1Q676U5 607 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 SLC25A41Q8N5S1 370 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 MPP4Q96JB8 637 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 RNF146Q9NTX7 359 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA11-201ENST00000006015 PARVAQ9NVD7 372 aa20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms