RNA–Protein interactions for RNA: YKL111C

YKL111C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL111C, Length 336 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL111CYKL111C YCR099CP25657 155 aa-0.28□□□□□ -2.45
YKL111CYKL111C IMP2P46972 177 aa-0.28□□□□□ -2.45
YKL111CYKL111C IRA1P18963 3092 aa-0.29□□□□□ -2.46
YKL111CYKL111C AIM11P87275 137 aa-0.29□□□□□ -2.46
YKL111CYKL111C YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa-0.29□□□□□ -2.46
YKL111CYKL111C DYN1P36022 4092 aa-0.29□□□□□ -2.46
YKL111CYKL111C RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
YKL111CYKL111C RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
YKL111CYKL111C MPC2P38857 129 aa-0.3□□□□□ -2.46
YKL111CYKL111C PAU15P40585 124 aa-0.3□□□□□ -2.46
YKL111CYKL111C YLR042CQ07990 161 aa-0.3□□□□□ -2.46
YKL111CYKL111C YOL118CQ08259 102 aa-0.3□□□□□ -2.46
YKL111CYKL111C VMA7P39111 118 aa-0.31□□□□□ -2.46
YKL111CYKL111C YLR365WQ7LIF2 110 aa-0.31□□□□□ -2.46
YKL111CYKL111C PAU16P35994 123 aa-0.32□□□□□ -2.46
YKL111CYKL111C GTT1P40582 234 aa-0.32□□□□□ -2.46
YKL111CYKL111C YDR210WQ03482 75 aa-0.32□□□□□ -2.46
YKL111CYKL111C SPC2Q04969 178 aa-0.32□□□□□ -2.46
YKL111CYKL111C YPL038W-AQ3E7B4 63 aa-0.32□□□□□ -2.46
YKL111CYKL111C RPO41P13433 1351 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
YKL111CYKL111C COX19Q3E731 98 aa-0.33□□□□□ -2.46
YKL111CYKL111C YCR101CP25607 182 aa-0.34□□□□□ -2.46
YKL111CYKL111C TRA1P38811 3744 aa-0.35□□□□□ -2.46
YKL111CYKL111C BUD23P25627 275 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
YKL111CYKL111C YNL198CP40166 100 aa-0.35□□□□□ -2.47
YKL111CYKL111C YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
YKL111CYKL111C RPC10P40422 70 aa-0.36□□□□□ -2.47
YKL111CYKL111C YIR021W-AQ3E739 70 aa-0.36□□□□□ -2.47
YKL111CYKL111C YFR009W-AP0C5M9 85 aa-0.37□□□□□ -2.47
YKL111CYKL111C ATX1P38636 73 aa-0.37□□□□□ -2.47
YKL111CYKL111C YGR164WP53291 111 aa-0.38□□□□□ -2.47
YKL111CYKL111C SGF11Q03067 99 aa-0.38□□□□□ -2.47
YKL111CYKL111C RTR2Q12378 196 aa-0.38□□□□□ -2.47
YKL111CYKL111C RIM15P43565 1770 aa-0.39□□□□□ -2.47
YKL111CYKL111C MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP-0.4□□□□□ -2.47
YKL111CYKL111C YBR016WP38216 128 aa-0.4□□□□□ -2.47
YKL111CYKL111C HUR1P45820 110 aa-0.4□□□□□ -2.47
YKL111CYKL111C MRX7P53869 86 aa-0.4□□□□□ -2.47
YKL111CYKL111C CUP1-1P0CX80 61 aa-0.41□□□□□ -2.48
YKL111CYKL111C CUP1-2P0CX81 61 aa-0.41□□□□□ -2.48
YKL111CYKL111C COX12Q01519 83 aa-0.41□□□□□ -2.48
YKL111CYKL111C SRB6P32570 121 aa-0.42□□□□□ -2.48
YKL111CYKL111C ICY1Q04329 127 aa-0.42□□□□□ -2.48
YKL111CYKL111C WIP1Q2V2P8 89 aa-0.42□□□□□ -2.48
YKL111CYKL111C YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
YKL111CYKL111C PAU6P0CE90 120 aa-0.43□□□□□ -2.48
YKL111CYKL111C PAU18P0CE91 120 aa-0.43□□□□□ -2.48
YKL111CYKL111C APS2Q00381 147 aa-0.43□□□□□ -2.48
YKL111CYKL111C YCR095W-AQ3E787 52 aa-0.44□□□□□ -2.48
YKL111CYKL111C YIL134C-AQ45U18 67 aa-0.44□□□□□ -2.48
YKL111CYKL111C YJR107C-AP0CT86 78 aa-0.45□□□□□ -2.48
YKL111CYKL111C RSM18P40033 138 aa-0.45□□□□□ -2.48
YKL111CYKL111C VMA21P41806 77 aa-0.45□□□□□ -2.48
YKL111CYKL111C YNR034W-AQ3E841 98 aa-0.45□□□□□ -2.48
YKL111CYKL111C SSN2P38931 1420 aa-0.46□□□□□ -2.48
YKL111CYKL111C SNA2P56508 79 aa-0.46□□□□□ -2.48
YKL111CYKL111C PAU20Q08322 120 aa-0.46□□□□□ -2.48
YKL111CYKL111C PAU5P43575 122 aa-0.47□□□□□ -2.48
YKL111CYKL111C MIC10Q96VH5 97 aa-0.47□□□□□ -2.48
YKL111CYKL111C SRB8P25648 1427 aa-0.47□□□□□ -2.49
YKL111CYKL111C MEC1P38111 2368 aa-0.48□□□□□ -2.49
YKL111CYKL111C YRF1-2P40105 1681 aa-0.48□□□□□ -2.49
YKL111CYKL111C TY1B-BLQ12490 1755 aa-0.48□□□□□ -2.49
YKL111CYKL111C CAT8P39113 1433 aa-0.48□□□□□ -2.49
YKL111CYKL111C YER039C-AP0CD97 72 aa-0.5□□□□□ -2.49
YKL111CYKL111C YBR292CP38357 123 aa-0.5□□□□□ -2.49
YKL111CYKL111C KRE5P22023 1365 aa-0.5□□□□□ -2.49
YKL111CYKL111C ROX3P25046 220 aa-0.51□□□□□ -2.49
YKL111CYKL111C MRP17P28778 131 aa-0.51□□□□□ -2.49
YKL111CYKL111C YBL071CP38185 102 aa-0.51□□□□□ -2.49
YKL111CYKL111C SWC7Q06707 132 aa-0.51□□□□□ -2.49
YKL111CYKL111C LYS2P07702 1392 aa-0.52□□□□□ -2.49
YKL111CYKL111C YOS1Q3E834 85 aa-0.53□□□□□ -2.49
YKL111CYKL111C SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
YKL111CYKL111C PAU1P0CE88 120 aa-0.55□□□□□ -2.5
YKL111CYKL111C PAU14P0CE89 120 aa-0.55□□□□□ -2.5
YKL111CYKL111C PAU8P0CE92 120 aa-0.55□□□□□ -2.5
YKL111CYKL111C PAU11P0CE93 120 aa-0.55□□□□□ -2.5
YKL111CYKL111C PAU13P38725 120 aa-0.55□□□□□ -2.5
YKL111CYKL111C RPL38P49167 78 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YKL111CYKL111C PAU10Q03050 120 aa-0.55□□□□□ -2.5
YKL111CYKL111C PAU9Q3E770 120 aa-0.55□□□□□ -2.5
YKL111CYKL111C YOR304C-AO14468 76 aa-0.56□□□□□ -2.5
YKL111CYKL111C YRF1-1P0CX20 1796 aa-0.56□□□□□ -2.5
YKL111CYKL111C YRF1-5P0CX21 1796 aa-0.56□□□□□ -2.5
YKL111CYKL111C YRF1-8P0CX22 1796 aa-0.56□□□□□ -2.5
YKL111CYKL111C LHP1P33399 275 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
YKL111CYKL111C YMR103CQ04436 120 aa-0.57□□□□□ -2.5
YKL111CYKL111C RSF2P46974 1380 aa-0.57□□□□□ -2.5
YKL111CYKL111C UBC4P15731 148 aa-0.58□□□□□ -2.5
YKL111CYKL111C GNA1P43577 159 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
YKL111CYKL111C SPP41P38904 1435 aa-0.58□□□□□ -2.5
YKL111CYKL111C AIM19P40502 157 aa-0.59□□□□□ -2.5
YKL111CYKL111C SPC1P46965 94 aa-0.59□□□□□ -2.5
YKL111CYKL111C RSM19P53733 91 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
YKL111CYKL111C YCR108CQ3E819 63 aa-0.59□□□□□ -2.5
YKL111CYKL111C BUD4P47136 1447 aa-0.6□□□□□ -2.51
YKL111CYKL111C PAU4P53427 120 aa-0.6□□□□□ -2.51
YKL111CYKL111C NHP10Q03435 203 aa-0.6□□□□□ -2.51
YKL111CYKL111C Q0032Q9ZZX7 96 aa-0.61□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 167.5 ms