RNA–Protein interactions for RNA: YGL197W

MDS3, Transcript of Putative component of the TOR regulatory pathway, yeast

Gene MDS3, Length 4,464 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDS3	YGL197W	TOR1	P35169	2470 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	HMRA1	P0CY11	126 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	YCR025C	P25352	136 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	DAD4	P69851	72 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	GPX1	P36014	167 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	SLM6	P38343	150 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	ALG13	P53178	202 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	YOL085C	Q99345	113 aa		0.92	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	PFY1	P07274	126 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	TOM6	P33448	61 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	YAR029W	P39549	74 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	YJL028W	P47062	111 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	TPC1	P53257	314 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	YMR103C	Q04436	120 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	FYV12	Q08559	129 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	YKL065W-A	Q2V2P2	73 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	PAU21	P0CE86	164 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	PAU22	P0CE87	164 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	MRS4	P23500	304 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	TRS20	P38334	175 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	YHL005C	P38752	130 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	DCV1	P43595	202 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	DAN1	P47178	298 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	PAU23	Q07987	124 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	YOL118C	Q08259	102 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	PAU17	Q12370	124 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	TIM9	O74700	87 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	YCR050C	P25630	102 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	0.91	□□□□□ -2.26	not detected
MDS3	YGL197W	YHR140W	P38842	239 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	YGR269W	P40326	108 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	YDR042C	Q03205	200 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	ATP20	Q12233	115 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	YKR045C	P36138	183 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	QCR10	P37299	77 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	PET8	P38921	284 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	RSM18	P40033	138 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	SFT1	P43682	97 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	MIX14	Q04341	121 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	ECM19	Q06011	112 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	YOR105W	Q08504	108 aa		0.91	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	YLR156W	P0CE96	114 aa		0.9	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	YLR159W	P0CE97	114 aa		0.9	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	YLR161W	P0CE98	114 aa		0.9	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	YFL019C	P43576	117 aa		0.9	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		0.9	□□□□□ -2.26
MDS3	YGL197W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	RRT1	P38192	103 aa		0.9	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	CWP2	P43497	92 aa		0.9	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	YHP1	Q04116	353 aa		0.9	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		0.9	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	ENV10	Q99382	181 aa		0.9	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	YGL193C	P53097	103 aa		0.9	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	YDL157C	Q12082	118 aa		0.9	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	YOR343C	Q12484	108 aa		0.9	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	HUB1	Q6Q546	73 aa		0.9	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	YPL229W	Q99395	206 aa		0.9	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	HMRA2	P0CY13	119 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	SPS100	P13130	326 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	AIM19	P40502	157 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	CYT2	Q00873	224 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	YPL261C	Q08976	102 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	OST5	Q92316	86 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	PAU1	P0CE88	120 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	PAU14	P0CE89	120 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	PAU6	P0CE90	120 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	PAU18	P0CE91	120 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	PAU8	P0CE92	120 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	PAU11	P0CE93	120 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	PAU2	P32612	120 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	PAU24	P38155	120 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	YBR292C	P38357	123 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	PAU13	P38725	120 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	SPI1	P40092	148 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	PAU12	P53343	120 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	PAU4	P53427	120 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	PAU10	Q03050	120 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	PIR1	Q03178	341 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	YLR296W	Q05898	108 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	PAU9	Q3E770	120 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	SEC11	P15367	167 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	ATP15	P21306	62 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
MDS3	YGL197W	YFL065C	P43539	102 aa		0.89	□□□□□ -2.27

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