RNA–Protein interactions for RNA: YGL145W

TIP20, Transcript of Peripheral membrane protein required for COPI vesicle fusion to the ER, yeast

Gene TIP20, Length 2,106 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TIP20	YGL145W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	3.02	□□□□□ -1.93	not detected
TIP20	YGL145W	FIT1	Q04433	528 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	VMA21	P41806	77 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	YDL157C	Q12082	118 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	YCR101C	P25607	182 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	NCE101	Q02820	53 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	COX19	Q3E731	98 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	CMC4	Q3E7A9	73 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	ANB1	P19211	157 aa		3	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	FYV7	Q12247	151 aa		3	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	SEC59	P20048	519 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	YEA6	P39953	335 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	KTI11	Q3E840	82 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	SSS1	P35179	80 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	YAR029W	P39549	74 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	AVO2	Q04749	426 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	YOR343C	Q12484	108 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	RPB7	P34087	171 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	QCR10	P37299	77 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	YHR007C-A	Q07074	71 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	FLO9	P39712	1322 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	YBR013C	P38215	129 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	RPS27B	P38711	82 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	PAU15	P40585	124 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	RAF1	Q06891	181 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	YBR292C	P38357	123 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	YGL230C	P53074	147 aa		2.97	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	HSP150	P32478	413 aa		2.96	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	ERV14	P53173	138 aa		2.96	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	SEN15	Q04675	128 aa		2.96	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		2.96	□□□□□ -1.93
TIP20	YGL145W	YMR082C	Q04276	118 aa		2.96	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	SRX1	P36077	127 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	RGM1	Q00453	211 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	YPR153W	Q06537	140 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	COA2	Q3E823	68 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	MRPL44	P19956	98 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	YKL044W	P36092	106 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	YEL014C	P39999	101 aa		2.95	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	YIL086C	P40503	102 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	PAU4	P53427	120 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	VAR1	P02381	398 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	PAU19	P0CE85	124 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	PAU21	P0CE86	164 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	PAU22	P0CE87	164 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	PAU3	P25610	124 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	MRPL15	P36523	253 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	TOM1	Q03280	3268 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	PAU1	P0CE88	120 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	PAU14	P0CE89	120 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	PAU6	P0CE90	120 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	PAU18	P0CE91	120 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	PAU8	P0CE92	120 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	PAU11	P0CE93	120 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	PAU13	P38725	120 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	PAU5	P43575	122 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	PAU10	Q03050	120 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	RCE1	Q03530	315 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	PAU20	Q08322	120 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	PAU9	Q3E770	120 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	COA6	Q3E846	104 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	FUN14	P18411	198 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	NRG2	P38082	220 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	YBR219C	P38317	127 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	HSP10	P38910	106 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	SNF11	P38956	169 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	YEL008W	P40001	126 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	YFR035C	P43608	114 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	CWC27	Q02770	301 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	YLR162W	Q06235	118 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	DCV1	P43595	202 aa		2.9	□□□□□ -1.94
TIP20	YGL145W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		2.9	□□□□□ -1.95
TIP20	YGL145W	QCR9	P22289	66 aa		2.9	□□□□□ -1.95
TIP20	YGL145W	YOL118C	Q08259	102 aa		2.9	□□□□□ -1.95
TIP20	YGL145W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
TIP20	YGL145W	YGL149W	P53116	101 aa		2.89	□□□□□ -1.95
TIP20	YGL145W	BRP1	P53194	125 aa		2.89	□□□□□ -1.95
TIP20	YGL145W	NAT5	Q08689	176 aa		2.89	□□□□□ -1.95
TIP20	YGL145W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		2.89	□□□□□ -1.95
TIP20	YGL145W	YGL010W	P25338	174 aa		2.89	□□□□□ -1.95
TIP20	YGL145W	YMR007W	Q03675	126 aa		2.89	□□□□□ -1.95
TIP20	YGL145W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		2.89	□□□□□ -1.95
TIP20	YGL145W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
TIP20	YGL145W	YFL051C	P43552	160 aa		2.88	□□□□□ -1.95

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