RNA–Protein interactions for RNA: YFR049W

YMR31, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene YMR31, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR31	YFR049W	PAU16	P35994	123 aa		1.09	□□□□□ -2.23
YMR31	YFR049W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	1.09	□□□□□ -2.23
YMR31	YFR049W	PAU15	P40585	124 aa		1.09	□□□□□ -2.23
YMR31	YFR049W	MVB12	P42939	101 aa		1.09	□□□□□ -2.23
YMR31	YFR049W	MRPS12	P53732	153 aa		1.09	□□□□□ -2.23
YMR31	YFR049W	MYO1	P08964	1928 aa		1.09	□□□□□ -2.24
YMR31	YFR049W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	1.08	□□□□□ -2.24
YMR31	YFR049W	CAT8	P39113	1433 aa		1.08	□□□□□ -2.24
YMR31	YFR049W	CCW14	O13547	238 aa		1.08	□□□□□ -2.24
YMR31	YFR049W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	1.08	□□□□□ -2.24
YMR31	YFR049W	YMR141C	P40211	102 aa		1.07	□□□□□ -2.24
YMR31	YFR049W	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	1.07	□□□□□ -2.24
YMR31	YFR049W	YOL118C	Q08259	102 aa		1.06	□□□□□ -2.24
YMR31	YFR049W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	1.06	□□□□□ -2.24
YMR31	YFR049W	SRB6	P32570	121 aa		1.05	□□□□□ -2.24
YMR31	YFR049W	YHL005C	P38752	130 aa		1.05	□□□□□ -2.24
YMR31	YFR049W	LCL1	Q02786	101 aa		1.05	□□□□□ -2.24
YMR31	YFR049W	YJR128W	P47162	119 aa		1.04	□□□□□ -2.24
YMR31	YFR049W	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	1.04	□□□□□ -2.24
YMR31	YFR049W	YDR210W	Q03482	75 aa		1.04	□□□□□ -2.24
YMR31	YFR049W	IMP2	P46972	177 aa		1.03	□□□□□ -2.24
YMR31	YFR049W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.24
YMR31	YFR049W	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		1.02	□□□□□ -2.25
YMR31	YFR049W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	1.01	□□□□□ -2.25
YMR31	YFR049W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	1.01	□□□□□ -2.25
YMR31	YFR049W	YLR255C	O13574	117 aa		1.01	□□□□□ -2.25
YMR31	YFR049W	ROX3	P25046	220 aa		1.01	□□□□□ -2.25
YMR31	YFR049W	PAU5	P43575	122 aa		1.01	□□□□□ -2.25
YMR31	YFR049W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		1.01	□□□□□ -2.25
YMR31	YFR049W	PDR10	P51533	1564 aa		1	□□□□□ -2.25
YMR31	YFR049W	RSF2	P46974	1380 aa		1	□□□□□ -2.25
YMR31	YFR049W	HMRA1	P0CY11	126 aa		1	□□□□□ -2.25
YMR31	YFR049W	YCR095W-A	Q3E787	52 aa		1	□□□□□ -2.25
YMR31	YFR049W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		1	□□□□□ -2.25
YMR31	YFR049W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		1	□□□□□ -2.25
YMR31	YFR049W	NTE1	Q04958	1679 aa		1	□□□□□ -2.25
YMR31	YFR049W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
YMR31	YFR049W	COX12	Q01519	83 aa		0.99	□□□□□ -2.25
YMR31	YFR049W	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		0.99	□□□□□ -2.25
YMR31	YFR049W	RRT15	Q3E811	62 aa		0.99	□□□□□ -2.25
YMR31	YFR049W	SRB8	P25648	1427 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YMR31	YFR049W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
YMR31	YFR049W	RPL43B	P0CX26	92 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YMR31	YFR049W	YIL086C	P40503	102 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YMR31	YFR049W	EMC5	P40540	141 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YMR31	YFR049W	COX19	Q3E731	98 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YMR31	YFR049W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
YMR31	YFR049W	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
YMR31	YFR049W	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	0.96	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	SNA2	P56508	79 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	YDR042C	Q03205	200 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	SHU1	P38751	150 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	YMR082C	Q04276	118 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	YDR029W	Q12111	104 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	PAU6	P0CE90	120 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	PAU18	P0CE91	120 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	MRP17	P28778	131 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	MPC2	P38857	129 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	RSM18	P40033	138 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	SSN2	P38931	1420 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	YLR157W-E	P0CF00	54 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	AIM19	P40502	157 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	MRX7	P53869	86 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	AUA1	P32450	94 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	YBL071C	P38185	102 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	NHP10	Q03435	203 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	ICY1	Q04329	127 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	LTE1	P07866	1435 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	GDB1	Q06625	1536 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	YBR292C	P38357	123 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	YBR072C-A	Q3E794	53 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	SWR1	Q05471	1514 aa		0.9	□□□□□ -2.26
YMR31	YFR049W	ECM12	O13529	151 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YMR31	YFR049W	SPC1	P46965	94 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YMR31	YFR049W	YDR010C	Q12426	110 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YMR31	YFR049W	POL1	P13382	1468 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YMR31	YFR049W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YMR31	YFR049W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YMR31	YFR049W	YSP2	Q06681	1438 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YMR31	YFR049W	YRF1-2	P40105	1681 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YMR31	YFR049W	PAU20	Q08322	120 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YMR31	YFR049W	RIM15	P43565	1770 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YMR31	YFR049W	PAU1	P0CE88	120 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YMR31	YFR049W	PAU14	P0CE89	120 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YMR31	YFR049W	PAU8	P0CE92	120 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YMR31	YFR049W	PAU11	P0CE93	120 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YMR31	YFR049W	PAU13	P38725	120 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YMR31	YFR049W	YHR173C	P38864	112 aa		0.87	□□□□□ -2.27

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