RNA–Protein interactions for RNA: YER009W

NTF2, Transcript of Nuclear envelope protein, yeastyeast

Gene NTF2, Length 378 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NTF2YER009W YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
NTF2YER009W PAU15P40585 124 aa-0.02□□□□□ -2.41
NTF2YER009W PAU16P35994 123 aa-0.03□□□□□ -2.41
NTF2YER009W YPL038W-AQ3E7B4 63 aa-0.03□□□□□ -2.41
NTF2YER009W RIM15P43565 1770 aa-0.04□□□□□ -2.42
NTF2YER009W HUR1P45820 110 aa-0.04□□□□□ -2.42
NTF2YER009W YGR164WP53291 111 aa-0.04□□□□□ -2.42
NTF2YER009W WIP1Q2V2P8 89 aa-0.04□□□□□ -2.42
NTF2YER009W YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
NTF2YER009W RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
NTF2YER009W RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
NTF2YER009W YCR101CP25607 182 aa-0.06□□□□□ -2.42
NTF2YER009W VMA21P41806 77 aa-0.06□□□□□ -2.42
NTF2YER009W RUB1Q03919 77 aa-0.06□□□□□ -2.42
NTF2YER009W RPO41P13433 1351 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
NTF2YER009W BUD23P25627 275 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
NTF2YER009W YIR021W-AQ3E739 70 aa-0.08□□□□□ -2.42
NTF2YER009W COX12Q01519 83 aa-0.09□□□□□ -2.42
NTF2YER009W SWC7Q06707 132 aa-0.09□□□□□ -2.42
NTF2YER009W SRB6P32570 121 aa-0.1□□□□□ -2.43
NTF2YER009W YBR056W-AI2HB52 66 aa-0.12□□□□□ -2.43
NTF2YER009W MRX7P53869 86 aa-0.12□□□□□ -2.43
NTF2YER009W YRF1-2P40105 1681 aa-0.13□□□□□ -2.43
NTF2YER009W MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP-0.13□□□□□ -2.43
NTF2YER009W ATX1P38636 73 aa-0.13□□□□□ -2.43
NTF2YER009W YNL198CP40166 100 aa-0.13□□□□□ -2.43
NTF2YER009W TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP-0.14□□□□□ -2.43
NTF2YER009W TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP-0.14□□□□□ -2.43
NTF2YER009W TY1B-BLQ12490 1755 aa-0.14□□□□□ -2.43
NTF2YER009W YER039C-AP0CD97 72 aa-0.14□□□□□ -2.43
NTF2YER009W SPP41P38904 1435 aa-0.14□□□□□ -2.43
NTF2YER009W PMD1P32634 1753 aa-0.14□□□□□ -2.43
NTF2YER009W HKR1P41809 1802 aa-0.15□□□□□ -2.43
NTF2YER009W ICY1Q04329 127 aa-0.15□□□□□ -2.43
NTF2YER009W SSN2P38931 1420 aa-0.15□□□□□ -2.43
NTF2YER009W YCR095W-AQ3E787 52 aa-0.16□□□□□ -2.44
NTF2YER009W MIC10Q96VH5 97 aa-0.16□□□□□ -2.44
NTF2YER009W SRB8P25648 1427 aa-0.16□□□□□ -2.44
NTF2YER009W TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa-0.17□□□□□ -2.44
NTF2YER009W TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa-0.17□□□□□ -2.44
NTF2YER009W TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa-0.17□□□□□ -2.44
NTF2YER009W TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
NTF2YER009W TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa-0.17□□□□□ -2.44
NTF2YER009W TY1B-JR1P47098 1755 aa-0.17□□□□□ -2.44
NTF2YER009W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
NTF2YER009W TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
NTF2YER009W TY1B-ER1Q03612 1755 aa-0.17□□□□□ -2.44
NTF2YER009W TY1B-DR1Q03855 1755 aa-0.17□□□□□ -2.44
NTF2YER009W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
NTF2YER009W TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
NTF2YER009W TY1B-GR1Q12141 1755 aa-0.17□□□□□ -2.44
NTF2YER009W TY1B-GR2Q12269 1755 aa-0.17□□□□□ -2.44
NTF2YER009W TY1B-OLQ12273 1755 aa-0.17□□□□□ -2.44
NTF2YER009W TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
NTF2YER009W TY1B-ORQ92393 1755 aa-0.17□□□□□ -2.44
NTF2YER009W TY1B-DR3Q99231 1755 aa-0.17□□□□□ -2.44
NTF2YER009W LYS2P07702 1392 aa-0.17□□□□□ -2.44
NTF2YER009W RPC10P40422 70 aa-0.17□□□□□ -2.44
NTF2YER009W YOS1Q3E834 85 aa-0.17□□□□□ -2.44
NTF2YER009W YBR292CP38357 123 aa-0.18□□□□□ -2.44
NTF2YER009W SNA2P56508 79 aa-0.18□□□□□ -2.44
NTF2YER009W UTP20P35194 2493 aaKnown RBP-0.18□□□□□ -2.44
NTF2YER009W YOR304C-AO14468 76 aa-0.19□□□□□ -2.44
NTF2YER009W YBR016WP38216 128 aa-0.19□□□□□ -2.44
NTF2YER009W SGF11Q03067 99 aa-0.19□□□□□ -2.44
NTF2YER009W TY1B-BRQ12193 1756 aa-0.19□□□□□ -2.44
NTF2YER009W KRE5P22023 1365 aa-0.19□□□□□ -2.44
NTF2YER009W YFR009W-AP0C5M9 85 aa-0.2□□□□□ -2.44
NTF2YER009W PAU6P0CE90 120 aa-0.2□□□□□ -2.44
NTF2YER009W PAU18P0CE91 120 aa-0.2□□□□□ -2.44
NTF2YER009W MRP17P28778 131 aa-0.2□□□□□ -2.44
NTF2YER009W RSM18P40033 138 aa-0.2□□□□□ -2.44
NTF2YER009W PAU20Q08322 120 aa-0.2□□□□□ -2.44
NTF2YER009W YNR034W-AQ3E841 98 aa-0.2□□□□□ -2.44
NTF2YER009W YRF1-1P0CX20 1796 aa-0.21□□□□□ -2.44
NTF2YER009W YRF1-5P0CX21 1796 aa-0.21□□□□□ -2.44
NTF2YER009W YRF1-8P0CX22 1796 aa-0.21□□□□□ -2.44
NTF2YER009W TY1B-MR1Q04214 1755 aa-0.21□□□□□ -2.44
NTF2YER009W TY1B-NL1Q12112 1755 aa-0.21□□□□□ -2.44
NTF2YER009W TY1B-GR3Q12316 1755 aa-0.21□□□□□ -2.44
NTF2YER009W PAU5P43575 122 aa-0.21□□□□□ -2.44
NTF2YER009W GNA1P43577 159 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
NTF2YER009W YIL134C-AQ45U18 67 aa-0.21□□□□□ -2.44
NTF2YER009W SPO14P36126 1683 aa-0.21□□□□□ -2.44
NTF2YER009W RSF2P46974 1380 aa-0.21□□□□□ -2.44
NTF2YER009W TY1B-ER2Q03619 1755 aa-0.22□□□□□ -2.44
NTF2YER009W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
NTF2YER009W BPT1P14772 1559 aa-0.22□□□□□ -2.44
NTF2YER009W STT4P37297 1900 aa-0.22□□□□□ -2.44
NTF2YER009W NTE1Q04958 1679 aa-0.22□□□□□ -2.44
NTF2YER009W SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.45
NTF2YER009W UBC4P15731 148 aa-0.23□□□□□ -2.45
NTF2YER009W TOR2P32600 2474 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
NTF2YER009W YMR103CQ04436 120 aa-0.24□□□□□ -2.45
NTF2YER009W YCR108CQ3E819 63 aa-0.24□□□□□ -2.45
NTF2YER009W CAT8P39113 1433 aa-0.24□□□□□ -2.45
NTF2YER009W TOR1P35169 2470 aa-0.24□□□□□ -2.45
NTF2YER009W ECM29P38737 1868 aa-0.24□□□□□ -2.45
NTF2YER009W ROX3P25046 220 aa-0.25□□□□□ -2.45
NTF2YER009W MOT1P32333 1867 aa-0.25□□□□□ -2.45
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