RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640888.1

LIAS-222, Transcript of lipoic acid synthetase, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIAS, Length 4,041 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LIAS-222	ENST00000640888	WDR90	Q96KV7	1748 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	GPR32	O75388	356 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	LRCH4	O75427	683 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	ZBED1	O96006	694 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	SETSIP	P0DME0	302 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	RBP3	P10745	1247 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	KRT15	P19012	456 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	ECHS1	P30084	290 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	ROR1	Q01973	937 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	LONRF1	Q17RB8	773 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	CCDC38	Q502W7	563 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	UNC93A	Q86WB7	457 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	METTL23	Q86XA0	190 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	ART4	Q93070	314 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	RNF34	Q969K3	372 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	LIAS	O43766	372 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	CAND2	O75155	1236 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	NEFH	P12036	1026 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	ARL4A	P40617	200 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	GPD2	P43304	727 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	ADCY1	Q08828	1119 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	BBS9	Q3SYG4	887 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	PALM2	Q8IXS6	379 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	GAD1	Q99259	594 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	RNF39	Q9H2S5	420 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	SHBG	P04278	402 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	KDELR1	P24390	212 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	IFNAR2	P48551	515 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	10.22	□□□□□ -0.77	2e-7	■■■■■ 49.4
LIAS-222	ENST00000640888	C17orf99	Q6UX52	265 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	ZFP42	Q96MM3	310 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	GPR182	O15218	404 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	RIPK2	O43353	540 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	TH	P07101	528 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	GHR	P10912	638 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	MLH1	P40692	756 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	ACADSB	P45954	432 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	TMED2	Q15363	201 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	BOLA3	Q53S33	107 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888		H0YHG0	523 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	APOL1	O14791	398 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	SLC6A3	Q01959	620 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	MAP3K6	O95382	1288 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	ETS1	P14921	441 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	PHB	P35232	272 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	ARL4C	P56559	192 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	MTM1	Q13496	603 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	ACAP1	Q15027	740 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	PMF1	Q6P1K2	205 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	PCGF5	Q86SE9	256 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	PDIK1L	Q8N165	341 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LIAS-222	ENST00000640888	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		10.21	□□□□□ -0.77

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