RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639956.1

SPIN3-232, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,998 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-232ENST00000639956 TXLNGQ9NUQ3 528 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 BTBD7Q9P203 1132 aa13.06□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 CCND1P24385 295 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 SERPINB3P29508 390 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 PTK7Q13308 1070 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 GADL1Q6ZQY3 521 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 PPIL6Q8IXY8 311 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 ATP11CQ8NB49 1132 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 FAF2Q96CS3 445 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 PEBP4Q96S96 227 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 AS3MTQ9HBK9 375 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 RAB6BQ9NRW1 208 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 GGA3Q9NZ52 723 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 STARD13Q9Y3M8 1113 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 A0A1B0GUA9 196 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 CYB561D2O14569 222 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 TNNC2P02585 160 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 F7P08709 466 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 HOXC6P09630 235 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 ZNF132P52740 706 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 HADHQ16836 314 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 ADPGKQ9BRR6 497 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 ARL8BQ9NVJ2 186 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 PIM2Q9P1W9 311 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 OGTO15294 1046 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 RNF8O76064 485 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 ITGAVP06756 1048 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 ABHD2P08910 425 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 IQCF3P0C7M6 154 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 RIPK1Q13546 671 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 ZNF667Q5HYK9 610 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 BSPRYQ5W0U4 402 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 WDR49Q8IV35 697 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 MAGEC3Q8TD91 643 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 MIS12Q9H081 205 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 MANSC1Q9H8J5 431 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 USP18Q9UMW8 372 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa13.05□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 NFKBIEO00221 500 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 MCF2LO15068 1137 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 KCNN4O15554 427 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 APRTP07741 180 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 INHBAP08476 426 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 RCN2Q14257 317 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 AMHR2Q16671 573 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 ATF7IP2Q5U623 682 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 FYB2Q5VWT5 728 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 DSTYKQ6XUX3 929 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 NAT8LQ8N9F0 302 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 XYLT2Q9H1B5 865 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 FAM49BQ9NUQ9 324 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 KANSL3Q9P2N6 904 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 SHOC2Q9UQ13 582 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 NFASCO94856 1347 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 SOWAHBA6NEL2 793 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 E5RJQ4 531 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 CCNB1P14635 433 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 PHBP35232 272 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 PCK1P35558 622 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 YARSP54577 528 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 MCL1Q07820 350 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 DPYSL3Q14195 570 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 DCAF15Q66K64 600 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 XRRA1Q6P2D8 792 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 CCHCR1Q8TD31 782 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 GRAMD1AQ96CP6 724 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 PGLYRP2Q96PD5 576 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 MIPEPQ99797 713 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 ELOVL4Q9GZR5 314 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 SLC17A6Q9P2U8 582 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 ACTL7BQ9Y614 415 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa13.04□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 GPR25O00155 361 aa13.03□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP13.03□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 HCRTO43612 131 aa13.03□□□□□ -0.32
SPIN3-232ENST00000639956 MICAL2O94851 1124 aa13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms