RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM83CQ9BQN1 747 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM206Q9H813 350 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 HPS4Q9NQG7 708 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 DENND4CQ5VZ89 1909 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 EML5Q05BV3 1969 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 FGF19O95750 216 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 ODC1P11926 461 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 LIG4P49917 911 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 GTF2BQ00403 316 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC39A12Q504Y0 691 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 ITIH6Q6UXX5 1313 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PQC6 194 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 H0YCG3 227 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 DPYSL4O14531 572 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 CETN3O15182 167 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 XPOTO43592 962 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 RAP1GAPP47736 663 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 KYAT1Q16773 422 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 FSTL4Q6MZW2 842 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 ITIH5Q86UX2 942 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 LGALS16A8MUM7 142 aa25.79■■□□□ 1.72
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CAPNS1-216ENST00000628306 PXNP49023 591 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 LIMK1P53667 647 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 ST3GAL2Q16842 350 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM196Q5HYL7 178 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC9A9Q8IVB4 645 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 NELFCDQ8IXH7 590 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 CCL26Q9Y258 94 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 ATG2BQ96BY7 2078 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 TISP43B9A030 160 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
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CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC6Q16204 474 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 ARMCX5Q6P1M9 558 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP68Q76N32 757 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 TMC6Q7Z403 805 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 CD302Q8IX05 232 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC150Q8NCX0 1101 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 GAB3Q8WWW8 586 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 MSTO1Q9BUK6 570 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 GKN1Q9NS71 199 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 OBSL1O75147 1896 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP295Q9C0D2 2601 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD63C9JTQ0 380 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 TGFB1I1O43294 461 aa25.77■■□□□ 1.72
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CAPNS1-216ENST00000628306 MGAT5BQ3V5L5 792 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 HS2ST1Q7LGA3 356 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 KBTBD6Q86V97 674 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 C12orf56Q8IXR9 622 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 CMTM8Q8IZV2 173 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 GIPC2Q8TF65 315 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM212AQ96EL1 285 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 ACCSQ96QU6 501 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 DERAQ9Y315 318 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 K7ENM7 598 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 AXIN1O15169 862 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 EPN2O95208 641 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 F11P03951 625 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF806P0C7X5 589 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 PMLP29590 882 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM132DQ14C87 1099 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 PLA2G2CQ5R387 149 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM68Q6AZZ1 485 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC8AQ8IWT6 810 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 IQCDQ96DY2 449 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
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CAPNS1-216ENST00000628306 TAB2Q9NYJ8 693 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 ESPNB1AK53 854 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 TEX33O43247 280 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 ACOT2P49753 483 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 MAN2A1Q16706 1144 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-216ENST00000628306 WSCD1Q658N2 575 aa25.75■■□□□ 1.71
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