RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621217.4

GGA3-222, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 4,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-222ENST00000621217 POMCP01189 267 aa9.48□□□□□ -0.89
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GGA3-222ENST00000621217 SLC1A1P43005 524 aa9.48□□□□□ -0.89
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GGA3-222ENST00000621217 C11orf63Q6NUN7 778 aa9.48□□□□□ -0.89
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GGA3-222ENST00000621217 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
GGA3-222ENST00000621217 CFAP69A5D8W1 941 aa9.46□□□□□ -0.89
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