RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 TRIP11Q15643 1979 aa22.8■■□□□ 1.24
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SGMS1-210ENST00000619438 CYP3A5P20815 502 aa22.8■■□□□ 1.24
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SGMS1-210ENST00000619438 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.8■■□□□ 1.24
SGMS1-210ENST00000619438 ZBTB6Q15916 424 aa22.8■■□□□ 1.24
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SGMS1-210ENST00000619438 SLC22A17Q8WUG5 538 aa22.8■■□□□ 1.24
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SGMS1-210ENST00000619438 CITO14578 2027 aa22.79■■□□□ 1.24
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SGMS1-210ENST00000619438 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SGMS1-210ENST00000619438 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
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SGMS1-210ENST00000619438 ZNF677Q86XU0 584 aa22.74■■□□□ 1.23
SGMS1-210ENST00000619438 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.74■■□□□ 1.23
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