RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 PCED1BQ96HM7 432 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 MMS19Q96T76 1030 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM9Q9C026 710 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP26.62■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 CYP27A1Q02318 531 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 STK38Q15208 465 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF507Q8TCN5 953 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 TTLL2Q9BWV7 592 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 CUEDC2Q9H467 287 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 NFATC1O95644 943 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 CST3P01034 146 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 ANXA13P27216 316 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 MPLP40238 635 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 PSMD2Q13200 908 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC26Q8TAB7 109 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 SMOC1Q9H4F8 434 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 EHD2Q9NZN4 543 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 NME7Q9Y5B8 376 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF840PA6NDX5 716 aa26.6■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 LEFTY2O00292 366 aa26.6■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM66O15016 1216 aa26.6■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 TGFB1I1O43294 461 aa26.6■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 STX6O43752 255 aa26.6■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 NOP14P78316 857 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
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PTPRF-216ENST00000617451 STPG1Q5TH74 334 aa26.6■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 CNNM4Q6P4Q7 775 aa26.6■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 RDH13Q8NBN7 331 aa26.6■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 C8orf48Q96LL4 319 aa26.6■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 VPS45Q9NRW7 570 aa26.6■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa26.6■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 PTPRDP23468 1912 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 DCLK1O15075 740 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 SPTLC2O15270 562 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 PPP6R2O75170 966 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 TACC1O75410 805 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 KRT37O76014 449 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 FAM163BP0C2L3 166 aa26.59■■□□□ 1.85
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PTPRF-216ENST00000617451 PPP3CCP48454 512 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 ASIC1P78348 528 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 SLC7A9P82251 487 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 ELF2Q15723 593 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 MDH1BQ5I0G3 518 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 KIAA1958Q8N8K9 716 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 USP33Q8TEY7 942 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 RNF38Q9H0F5 515 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 SNX25Q9H3E2 840 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 MYO16Q9Y6X6 1858 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 F8VP50 259 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 K7EQS6 105 aa26.58■■□□□ 1.85
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PTPRF-216ENST00000617451 GAB4Q2WGN9 574 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 FAM26FQ5R3K3 315 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 DHX58Q96C10 678 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 FNBP1Q96RU3 617 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 CGRRF1Q99675 332 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 FOXD4L1Q9NU39 408 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 HELZP42694 1942 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
PTPRF-216ENST00000617451 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa26.58■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 OLFM2O95897 454 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 CYP24A1Q07973 514 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 HS2ST1Q7LGA3 356 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 IQUBQ8NA54 791 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 TSTD1Q8NFU3 115 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 OR6B3Q8NGW1 331 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC127Q96BQ5 260 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 C7orf25Q9BPX7 421 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 CLIC2O15247 247 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 DGKEP52429 567 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 WDR72Q3MJ13 1102 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 C2orf27AQ580R0 203 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 TCEAL6Q6IPX3 200 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa26.56■■□□□ 1.84
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PTPRF-216ENST00000617451 XXYLT1Q8NBI6 393 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 SCFD1Q8WVM8 642 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 TCEAL3Q969E4 200 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM30AQ9NV96 361 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 OAS1P00973 400 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 CYP17A1P05093 508 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 CYP2J2P51589 502 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 CACNA2D1P54289 1103 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 TNNC1P63316 161 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 EHHADHQ08426 723 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 TAF10Q12962 218 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
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