RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615579.1

TTC28-AS1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_3, Length 181 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AIPL1Q9NZN9 384 aa15.38■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IMPACTQ9P2X3 320 aa15.38■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C2orf16Q68DN1 1984 aa15.38■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TBX10O75333 385 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LCP1P13796 627 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CHRNB2P17787 502 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MAGEA11P43364 429 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TUFMP49411 452 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CNGA2Q16280 664 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 VSTM1Q6UX27 236 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCDC186Q7Z3E2 898 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TCEAL8Q8IYN2 117 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ANKRD52Q8NB46 1076 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZMIZ2Q8NF64 920 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EYSQ5T1H1 3165 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GREB1Q4ZG55 1949 aa15.37■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC38A8A6NNN8 435 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZMYND10O75800 440 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SETSIPP0DME0 302 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRKCIP41743 596 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EPHB3P54753 998 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HGSNATQ68CP4 663 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WDR59Q6PJI9 974 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PIGZQ86VD9 579 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF677Q86XU0 584 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DNAAF5Q86Y56 855 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ELMOD1Q8N336 334 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CPA5Q8WXQ8 436 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CHP1Q99653 195 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SYNCQ9H7C4 482 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SFXN1Q9H9B4 322 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PIDD1Q9HB75 910 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DZANK1Q9NVP4 752 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CYTH4Q9UIA0 394 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CDH22Q9UJ99 828 aa15.36■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC5A3P53794 718 aa15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ADIGQ0VDE8 80 aa15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PDCLQ13371 301 aa15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C2CD6Q53TS8 623 aa15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CYP4A22Q5TCH4 519 aa15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ANKRD54Q6NXT1 300 aa15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 VPS36Q86VN1 386 aa15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HS6ST3Q8IZP7 471 aa15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMEM35BQ8NCS4 154 aa15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SCAMP5Q8TAC9 235 aa15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC30A5Q8TAD4 765 aa15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PCDHB18PQ96TA0 734 aa15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CORO1BQ9BR76 489 aa15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MIS12Q9H081 205 aa15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LRRC4Q9HBW1 653 aa15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TJP2Q9UDY2 1190 aa15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DPP7Q9UHL4 492 aa15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PCDHGC3Q9UN70 934 aa15.35■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OBSL1O75147 1896 aa15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 H3BQ06 376 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 XYLBO75191 536 aa15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MYL4P12829 197 aa15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GPD2P43304 727 aa15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GSDMDP57764 484 aa15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 USP46P62068 366 aa15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NOMO3P69849 1222 aa15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NTHL1P78549 312 aa15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ADAM15Q13444 863 aa15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PMF1Q6P1K2 205 aa15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C8orf48Q96LL4 319 aa15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PANX2Q96RD6 677 aa15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C11orf70Q9BRQ4 267 aa15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SPTLC3Q9NUV7 552 aa15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TAS2R14Q9NYV8 317 aa15.34■□□□□ 0.05
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SOWAHDA6NJG2 315 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HHLA1C9JL84 531 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 E5RJQ4 531 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AKR1B10O60218 316 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ABL1P00519 1130 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KCNA5P22460 613 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NSFP46459 744 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PLA2G4AP47712 749 aa15.33■□□□□ 0.04
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TKTL1P51854 596 aa15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms