RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597718.5

FCHO1-222, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 884 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-222ENST00000597718 USP17L7P0C7H9 530 aa15.04■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 PXNP49023 591 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 MYL6P60660 151 aa15.04■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 TNNC1P63316 161 aa15.04■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP15.04■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 USP4Q13107 963 aa15.04■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP15.04■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 KCNB1Q14721 858 aa15.04■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 ZNF77Q15935 545 aa15.04■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 BMT2Q1RMZ1 405 aa15.04■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 TMEM196Q5HYL7 178 aa15.04■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 CEP57L1Q8IYX8 460 aa15.04■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 FSIP1Q8NA03 581 aa15.04■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 OR6B3Q8NGW1 331 aa15.04■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa15.04■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 PLEKHO2Q8TD55 490 aa15.04■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 ELMO3Q96BJ8 720 aa15.04■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 GCNT4Q9P109 453 aa15.04■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 F8VP50 259 aa15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 EGFP01133 1207 aa15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 TGM1P22735 817 aa15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 ANXA13P27216 316 aa15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 IFNAR2P48551 515 aa15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 CACNA2D1P54289 1103 aa15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 SPEM2Q0P670 501 aa15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 TRPC3Q13507 836 aa15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 PDGFRLQ15198 375 aa15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 LAIR1Q6GTX8 287 aa15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 VSTM1Q6UX27 236 aa15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 LONP2Q86WA8 852 aa15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 SYNPOQ8N3V7 929 aa15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 CPA6Q8N4T0 437 aa15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 SH3RF2Q8TEC5 729 aa15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 OSCP1Q8WVF1 389 aa15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 SPATA17Q96L03 361 aa15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 TIGD1Q96MW7 591 aa15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 DLL3Q9NYJ7 618 aa15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 PTPRDP23468 1912 aa15.03■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 GREB1Q4ZG55 1949 aa15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 CLDN5O00501 218 aa15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 TRIM66O15016 1216 aa15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 KLRC4O43908 158 aa15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 RNF40O75150 1001 aa15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 PHACTR2O75167 634 aa15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 TACC1O75410 805 aa15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 SLFN14P0C7P3 912 aa15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 HDCP19113 662 aa15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 GJA4P35212 333 aa15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 RAP1GAPP47736 663 aa15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 STK4Q13043 487 aa15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 BIRC3Q13489 604 aa15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 C12orf56Q8IXR9 622 aa15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 KIAA0895Q8NCT3 520 aa15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 PAGE5Q96GU1 130 aa15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 XYLT2Q9H1B5 865 aa15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 SMYD3Q9H7B4 428 aa15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 ECT2Q9H8V3 914 aa15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 EXOC1Q9NV70 894 aa15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 TMEM30AQ9NV96 361 aa15.02■□□□□ -0
FCHO1-222ENST00000597718 CEP250Q9BV73 2442 aa15.01□□□□□ -0.01
FCHO1-222ENST00000597718 A0A1B0GVL5 298 aa15.01□□□□□ -0.01
FCHO1-222ENST00000597718 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
FCHO1-222ENST00000597718 A8MXQ7 604 aa15.01□□□□□ -0.01
FCHO1-222ENST00000597718 ABL1P00519 1130 aa15.01□□□□□ -0.01
FCHO1-222ENST00000597718 PFKFB1P16118 471 aa15.01□□□□□ -0.01
FCHO1-222ENST00000597718 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
FCHO1-222ENST00000597718 GALK1P51570 392 aa15.01□□□□□ -0.01
FCHO1-222ENST00000597718 ZXDBP98169 803 aa15.01□□□□□ -0.01
FCHO1-222ENST00000597718 AMPD2Q01433 879 aa15.01□□□□□ -0.01
FCHO1-222ENST00000597718 LMNB2Q03252 620 aa15.01□□□□□ -0.01
FCHO1-222ENST00000597718 EML3Q32P44 896 aa15.01□□□□□ -0.01
FCHO1-222ENST00000597718 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
FCHO1-222ENST00000597718 SASS6Q6UVJ0 657 aa15.01□□□□□ -0.01
FCHO1-222ENST00000597718 CEP68Q76N32 757 aa15.01□□□□□ -0.01
FCHO1-222ENST00000597718 ATP2A3Q93084 1043 aa15.01□□□□□ -0.01
FCHO1-222ENST00000597718 P2RY13Q9BPV8 354 aa15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms