RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589475.1

EFTUD2-213, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 200 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-213ENST00000589475 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
EFTUD2-213ENST00000589475 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
EFTUD2-213ENST00000589475 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP5.78□□□□□ -1.48
EFTUD2-213ENST00000589475 IRAK3Q9Y616 596 aa5.78□□□□□ -1.48
EFTUD2-213ENST00000589475 KIAA1671Q9BY89 1806 aa5.78□□□□□ -1.48
EFTUD2-213ENST00000589475 VWA8A3KMH1 1905 aa5.78□□□□□ -1.48
EFTUD2-213ENST00000589475 LCHNA4D1U4 455 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 F8W810 466 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 I3L4J1 428 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 M0QYV0 167 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 SART1O43290 800 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 ZSCAN12O43309 604 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 TBC1D4O60343 1298 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 RTN2O75298 545 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 NDUFA10O95299 355 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 LCA5LO95447 670 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 CALB1P05937 261 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 CCDC175P0C221 793 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 FAM200BP0CF97 657 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 MYBL1P10243 752 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 CPB1P15086 417 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 NPR3P17342 541 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 BRD2P25440 801 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 MAGEA11P43364 429 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 NSFP46459 744 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 NDUFV1P49821 464 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 RABGGTBP53611 331 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 CCZ1BP86790 482 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 FMO1Q01740 532 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 CENPCQ03188 943 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 GOLGA8FQ08AF8 430 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 VAC14Q08AM6 782 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 GPR17Q13304 367 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 PTPROQ16827 1216 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 CTC1Q2NKJ3 1217 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 LRIT3Q3SXY7 679 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 CFAP221Q4G0U5 840 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 MDH1BQ5I0G3 518 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 RTP2Q5QGT7 225 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 LIN9Q5TKA1 542 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 TAF3Q5VWG9 929 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 SCARA3Q6AZY7 606 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC8B1Q6J4K2 584 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 FAM171BQ6P995 826 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 VSTM1Q6UX27 236 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 RTL10Q7L3V2 364 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 TMC7Q7Z402 723 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 FAM35AQ86V20 835 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 TMEM139Q8IV31 216 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 GLYCTKQ8IVS8 523 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 TMEM130Q8N3G9 435 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 ANKRD52Q8NB46 1076 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 KLHL23Q8NBE8 558 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 STK32AQ8WU08 396 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 POF1BQ8WVV4 589 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 ELMO3Q96BJ8 720 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 TIFAQ96CG3 184 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 CYFIP2Q96F07 1278 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 VCPIP1Q96JH7 1222 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 TWNKQ96RR1 684 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 CHP1Q99653 195 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 SYT11Q9BT88 431 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 MED10Q9BTT4 135 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 DUSP16Q9BY84 665 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 PBX4Q9BYU1 374 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 UBXN6Q9BZV1 441 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 TSGA10Q9BZW7 698 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 ZBP1Q9H171 429 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 RXFP1Q9HBX9 757 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 FAM49BQ9NUQ9 324 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 EHD2Q9NZN4 543 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 WDR35Q9P2L0 1181 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 HMGXB4Q9UGU5 601 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 DPP7Q9UHL4 492 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 LCMT1Q9UIC8 334 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 TSPAN16Q9UKR8 245 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 INTUQ9ULD6 942 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-213ENST00000589475 STRIP2Q9ULQ0 834 aa5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms