RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 OVOS1Q6IE37 1185 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 CLEC20AQ6ZU45 233 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 POLNQ7Z5Q5 900 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 PNKPQ96T60 521 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 CNPY3Q9BT09 278 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC1Q9BTT6 524 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 USTQ9Y2C2 406 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 CLDN5O00501 218 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 SYN3O14994 580 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA0355O15063 1070 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAPPC3O43617 180 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 OAZ2O95190 189 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM200BP0CF97 657 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 MCM3P25205 808 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 OR1G1P47890 313 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
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CAPNS1-207ENST00000589146 AADACL2Q6P093 401 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC26A9Q7LBE3 791 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM35AQ86V20 835 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 PIGZQ86VD9 579 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 RCOR2Q8IZ40 523 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 HASPINQ8TF76 798 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 PCED1BQ96HM7 432 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 MED10Q9BTT4 135 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 COLEC11Q9BWP8 271 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 ASNSD1Q9NWL6 643 aa23.94■■□□□ 1.42
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CAPNS1-207ENST00000589146 F8W810 466 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 PCK1P35558 622 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 IKBKEQ14164 716 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 TRNP1Q6NT89 227 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 NECAB2Q7Z6G3 386 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 SCUBE3Q8IX30 993 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 EMC1Q8N766 993 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 MAIP1Q8WWC4 291 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 RXFP2Q8WXD0 754 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT12Q99456 494 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 NCAPGQ9BPX3 1015 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 AP1M1Q9BXS5 423 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC151A5D8V7 595 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 NRP1O14786 923 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 LRCH4O75427 683 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 TIMP1P01033 207 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 PTPN7P35236 360 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 GATMP50440 423 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 COPS2P61201 443 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
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CAPNS1-207ENST00000589146 C8orf74Q6P047 294 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 DEFB128Q7Z7B8 93 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 OR10T2Q8NGX3 314 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 MYLPFQ96A32 169 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 SMARCD1Q96GM5 515 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 SMOQ99835 787 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT82Q9NSB4 513 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 LTBP2Q14767 1821 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 PIK3R2O00459 728 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 TADA2AO75478 443 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 AP1G2O75843 785 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 BEST1O76090 585 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 ALDH2P05091 517 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT7P08729 469 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 TCF4P15884 667 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 FLT3P36888 993 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 PTPN9P43378 593 aa23.91■■□□□ 1.42
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CAPNS1-207ENST00000589146 EFHC1Q5JVL4 640 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM106CQ9BVX2 250 aa23.91■■□□□ 1.42
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CAPNS1-207ENST00000589146 NR2E1Q9Y466 385 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 TBKBP1A7MCY6 615 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF8O76064 485 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 FBXO21O94952 628 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 GLI1P08151 1106 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 PDGFRAP16234 1089 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-207ENST00000589146 SSR1P43307 286 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
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