RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 ZCCHC18P0CG32 403 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 SOAT1P35610 550 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 STKLD1Q8NE28 680 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 CYP11B1P15538 503 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 PDIA6Q15084 440 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 TFDP3Q5H9I0 405 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 CENPPQ6IPU0 288 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 TTI2Q6NXR4 508 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 GPRASP2Q96D09 838 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 PLEKHA8Q96JA3 519 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 M0QYT0 321 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 CYP2C9P11712 490 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 KCNT1Q5JUK3 1230 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 NOTUMQ6P988 496 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 GPR141Q7Z602 305 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 LUZP2Q86TE4 346 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 SOAT2O75908 522 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 RARGP13631 454 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 EPHB2P29323 1055 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 TAF6P49848 677 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 STX5Q13190 355 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 AMHR2Q16671 573 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 CHST13Q8NET6 341 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 MICU2Q8IYU8 434 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 PHF21AQ96BD5 680 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 ECSITQ9BQ95 431 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 GPRC5CQ9NQ84 441 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 PMPCBO75439 489 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 USP1O94782 785 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 RALBP11234 206 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 SERPINB8P50452 374 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 COQ7Q99807 217 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 HPS4Q9NQG7 708 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 GIT2Q14161 759 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 MTFR1Q15390 333 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC6Q86X45 466 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 CHSY1Q86X52 802 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 AP4S1Q9Y587 144 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 EVPLLA8MZ36 301 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 AGAP9Q5VTM2 703 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC81Q6ZN84 652 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 P3H2Q8IVL5 708 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 HS6ST3Q8IZP7 471 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 CEP152O94986 1710 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 MAP3K6O95382 1288 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 CYP2C8P10632 490 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
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PTPRM-211ENST00000580170 DLC1Q96QB1 1528 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 MUTP22033 750 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 PNPLA4P41247 253 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 C10orf120Q5SQS8 335 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 WDCPQ9H6R7 721 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 SLC25A27O95847 323 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 PGK2P07205 417 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 SNAPC2Q13487 334 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 TLK2Q86UE8 772 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF786Q8N393 782 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC33Q8N5R6 958 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 FIGNQ5HY92 759 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 SCUBE1Q8IWY4 988 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM245Q9H330 911 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 THRAP10827 490 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 GEMP55040 296 aa22.09■■□□□ 1.13
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PTPRM-211ENST00000580170 L1RE1Q9UN81 338 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 HARS2P49590 506 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 NUDT18Q6ZVK8 323 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 PRRG1O14668 218 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 CYTH3O43739 400 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 UNC45BQ8IWX7 931 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 PAFAH2Q99487 392 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 OSGEPQ9NPF4 335 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 APPL1Q9UKG1 709 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 TPST1O60507 370 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 KLRK1P26718 216 aa22.09■■□□□ 1.13
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