RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578773.1

GGA3-206, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 5

Gene GGA3, Length 432 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-206	ENST00000578773	APOD	P05090	189 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	HOXB2	P14652	356 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	PROZ	P22891	400 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	LRPAP1	P30533	357 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	RCAN1	P53805	252 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	NR1H3	Q13133	447 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	DNAJC3	Q13217	504 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	RTP5	Q14D33	572 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	DHCR24	Q15392	516 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	PKDCC	Q504Y2	493 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773		Q6ZUG5	572 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	SENP8	Q96LD8	212 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	KIF2C	Q99661	725 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	CKAP5	Q14008	2032 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	STK36	Q9NRP7	1315 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	MEI4	A8MW99	385 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	CER1	O95813	267 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	USP17L7	P0C7H9	530 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	MYF5	P13349	255 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	JUP	P14923	745 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	IFNAR1	P17181	557 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	TYMP	P19971	482 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	RHD	Q02161	417 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	REST	Q13127	1097 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	DDR2	Q16832	855 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	PADI6	Q6TGC4	694 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	NAT16	Q8N8M0	369 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	TSC1	Q92574	1164 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	FGF11	Q92914	225 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	MED8	Q96G25	268 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	WBP1	Q96G27	269 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	TMEM206	Q9H813	350 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-206	ENST00000578773	CACNA1D	Q01668	2161 aa		11.96	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	LRBA	P50851	2863 aa		11.96	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	KCNJ18	B7U540	433 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	LEFTY2	O00292	366 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	NDUFS2	O75306	463 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	GP1BB	P13224	206 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	GNS	P15586	552 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	NFATC3	Q12968	1075 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	ZBTB6	Q15916	424 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	KIF19	Q2TAC6	998 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	HES3	Q5TGS1	186 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	GPR174	Q9BXC1	333 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773		A0A0A0MRY4	1105 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	MYMK	A6NI61	221 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773		K7ERI5	159 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	MCF2	P10911	925 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	ODC1	P11926	461 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	NCAM1	P13591	858 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	CYP11B2	P19099	503 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	LILRA4	P59901	499 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GGA3-206	ENST00000578773	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5

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