RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.25	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.25	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		4.25	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	TMX2	Q9Y320	296 aa		4.25	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		4.25	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		4.24	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		4.24	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	FRS3	O43559	492 aa		4.24	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	C21orf58	P58505	322 aa		4.24	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.24	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	BMPR2	Q13873	1038 aa		4.24	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	GBX1	Q14549	363 aa		4.24	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		4.24	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		4.24	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	C14orf80	Q86SX3	495 aa		4.24	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	MICU3	Q86XE3	530 aa		4.24	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		4.24	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		4.24	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.24	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	TTC8	Q8TAM2	541 aa		4.24	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		4.24	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		4.24	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		4.24	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		4.24	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		4.24	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	AOX1	Q06278	1338 aa		4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	IQGAP2	Q13576	1575 aa		4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	C3	P01024	1663 aa		4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	VSTM5	A8MXK1	200 aa		4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	ZNF213	O14771	459 aa		4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	MARCH6	O60337	910 aa		4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	HRG	P04196	525 aa		4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	CYP2C9	P11712	490 aa		4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	DRD4	P21917	467 aa		4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	KCNA3	P22001	575 aa		4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	DGKE	P52429	567 aa		4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	OR56A3	Q8NH54	315 aa		4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	MASP2	O00187	686 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	TPP1	O14773	563 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	TLR5	O60602	858 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	TTLL1	O95922	423 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	ZBED1	O96006	694 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	LRPAP1	P30533	357 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	SLC7A1	P30825	629 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	CCT8	P50990	548 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	CLCN2	P51788	898 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	SOX10	P56693	466 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	TFF2	Q03403	129 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	SLC13A2	Q13183	592 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	TREML2	Q5T2D2	321 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	LAYN	Q6UX15	382 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	ZNF384	Q8TF68	577 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	GLG1	Q92896	1179 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	VOPP1	Q96AW1	172 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	REPS1	Q96D71	796 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	WDR26	Q9H7D7	661 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	OBP2A	Q9NY56	170 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		4.22	□□□□□ -1.73
COX11-208	ENST00000576084	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		4.22	□□□□□ -1.73

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