RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574728.1

PRPF8-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 466 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-211ENST00000574728 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
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PRPF8-211ENST00000574728 NUP133Q8WUM0 1156 aa5.44□□□□□ -1.54
PRPF8-211ENST00000574728 CRYGNQ8WXF5 182 aa5.44□□□□□ -1.54
PRPF8-211ENST00000574728 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PRPF8-211ENST00000574728 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa5.44□□□□□ -1.54
PRPF8-211ENST00000574728 CTAGE1Q96RT6 745 aa5.44□□□□□ -1.54
PRPF8-211ENST00000574728 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PRPF8-211ENST00000574728 HIST1H2AJQ99878 128 aa5.44□□□□□ -1.54
PRPF8-211ENST00000574728 LZTS2Q9BRK4 669 aa5.44□□□□□ -1.54
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