RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 STKLD1Q8NE28 680 aa18.18■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 FBXL13Q8NEE6 735 aa18.18■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 CLDN23Q96B33 292 aa18.18■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 SMARCD1Q96GM5 515 aa18.18■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa18.18■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 SDCBP2Q9H190 292 aa18.18■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa18.18■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAN1B1Q9UKM7 699 aa18.18■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 GREB1Q4ZG55 1949 aa18.17■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa18.17■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 NDST1P52848 882 aa18.17■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANGPT1Q15389 498 aa18.17■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPOPLQ6IQ16 392 aa18.17■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM35AQ86V20 835 aa18.17■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 CEP63Q96MT8 703 aa18.17■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRC3BQ96PB8 259 aa18.17■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 IER2Q9BTL4 223 aa18.17■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 MED10Q9BTT4 135 aa18.17■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 F5P12259 2224 aa18.17■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa18.16■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 BICDL2A1A5D9 508 aa18.16■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 TARSP26639 723 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 PMS1P54277 932 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 MORC3Q14149 939 aa18.16■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 ACOT1Q86TX2 421 aa18.16■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRIML1Q8N9V2 468 aa18.16■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDZD8Q8NEN9 1154 aa18.16■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 OVCA2Q8WZ82 227 aa18.16■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM3CQ92520 227 aa18.16■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 EEF2KMTQ96G04 330 aa18.16■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLITRK1Q96PX8 696 aa18.16■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 NT5C1AQ9BXI3 368 aa18.16■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 MMRN2Q9H8L6 949 aa18.16■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRPC7Q9HCX4 862 aa18.16■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 COMMD8Q9NX08 183 aa18.16■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAB20Q9NX57 234 aa18.16■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 SHISA7A6NL88 538 aa18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 CLDN5O00501 218 aa18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 CKMP06732 381 aa18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 TCF3P15923 654 aa18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 CD72P21854 359 aa18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 NBL1P41271 181 aa18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 USP46P62068 366 aa18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 WDR44Q5JSH3 913 aa18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 TCERG1LQ5VWI1 586 aa18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 ASCL5Q7RTU5 278 aa18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 FRMD5Q7Z6J6 570 aa18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 C1orf210Q8IVY1 113 aa18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 FUKQ8N0W3 1084 aa18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 NUP93Q8N1F7 819 aa18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF687Q8N1G0 1237 aa18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIAA1958Q8N8K9 716 aa18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 ELMO3Q96BJ8 720 aa18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM30AQ9NV96 361 aa18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 GCNT4Q9P109 453 aa18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCL26Q9Y258 94 aa18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 COQ4Q9Y3A0 265 aa18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPTBN4Q9H254 2564 aa18.14■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRIM49BA6NDI0 452 aa18.14■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 HDCP19113 662 aa18.14■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 YWHAQP27348 245 aa18.14■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 CACNA2D1P54289 1103 aa18.14■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDGFRLQ15198 375 aa18.14■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa18.14■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 PAQR9Q6ZVX9 377 aa18.14■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa18.14■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPIHBP1Q8IV16 184 aa18.14■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM83CQ9BQN1 747 aa18.14■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa18.14■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRT82Q9NSB4 513 aa18.14■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa18.14■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa18.13■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 COL4A3Q01955 1670 aa18.13■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF840PA6NDX5 716 aa18.13■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRR23AA6NEV1 266 aa18.13■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa18.13■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa18.13■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRN2O75325 713 aa18.13■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 CILPO75339 1184 aa18.13■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 AP1G2O75843 785 aa18.13■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 CD44P16070 742 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 BMP6P22004 513 aa18.13■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 AMPD2Q01433 879 aa18.13■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 TAF10Q12962 218 aa18.13■□□□□ 0.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 USP4Q13107 963 aa18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms