RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 ZBED9Q6R2W3 1325 aa5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa5.14□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 NOP56O00567 594 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 TSPY3P0CV98 308 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 TSPY8P0CW00 308 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 CNR2P34972 360 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 LIMS1P48059 325 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 SEPHS1P49903 392 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 AMPD2Q01433 879 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 TFAP4Q01664 338 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 CREB5Q02930 508 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 PPFIA1Q13136 1202 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 MTX1Q13505 466 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 CLLU1OSQ5K130 101 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 TAF2Q6P1X5 1199 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 Q6ZS52 159 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 SLC24A5Q71RS6 500 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 IL31RAQ8NI17 732 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 KLHL6Q8WZ60 621 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM169Q96HH4 297 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM117Q9H0C3 514 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM9BQ9NQ34 198 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM161AQ9NX61 479 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 TUBE1Q9UJT0 475 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 STX8Q9UNK0 236 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 TRPV2Q9Y5S1 764 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 BACE2Q9Y5Z0 518 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 CCDC171Q6TFL3 1326 aa5.13□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 DCLK1O15075 740 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 BCAR3O75815 825 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 RPP40O75818 363 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 CAVIN2O95810 425 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 CCDC192P0DO97 292 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 ADD2P35612 726 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 CCR10P46092 362 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 PRR5P85299 388 aa5.12□□□□□ -1.59
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TMOD3-210ENST00000561408 CYP4F3Q08477 520 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
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TMOD3-210ENST00000561408 PHKBQ93100 1093 aa5.12□□□□□ -1.59
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TMOD3-210ENST00000561408 IWS1Q96ST2 819 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 PHF20Q9BVI0 1012 aa5.12□□□□□ -1.59
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TMOD3-210ENST00000561408 SEMA4CQ9C0C4 833 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 NT5C3AQ9H0P0 336 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 XYLT2Q9H1B5 865 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 PXMP2Q9NR77 195 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 IL17RBQ9NRM6 502 aa5.12□□□□□ -1.59
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TMOD3-210ENST00000561408 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 CACNA1DQ01668 2161 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 GON4LQ3T8J9 2241 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 VWA8A3KMH1 1905 aa5.11□□□□□ -1.59
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TMOD3-210ENST00000561408 GSG1L2A8MUP6 293 aa5.11□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 B4GALT3O60512 393 aa5.11□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 RPS6KA5O75582 802 aa5.11□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 SURF6O75683 361 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 GLI4P10075 376 aa5.11□□□□□ -1.59
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TMOD3-210ENST00000561408 FAM189BP81408 668 aa5.11□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 SBK1Q52WX2 424 aa5.11□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 VHLLQ6RSH7 139 aa5.11□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 BTNL9Q6UXG8 535 aa5.11□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 TAS1R1Q7RTX1 841 aa5.11□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
TMOD3-210ENST00000561408 WDR5BQ86VZ2 330 aa5.11□□□□□ -1.59
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