RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560359.1

GABPB1-AS1-204, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 709 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BEST1O76090 585 aa25.39■■□□□ 1.66
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLC34A2O95436 690 aa25.39■■□□□ 1.66
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 JAM2P57087 298 aa25.39■■□□□ 1.66
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MTMR3Q13615 1198 aa25.39■■□□□ 1.66
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CNGA2Q16280 664 aa25.39■■□□□ 1.66
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CYP4A22Q5TCH4 519 aa25.39■■□□□ 1.66
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LCLAT1Q6UWP7 414 aa25.39■■□□□ 1.66
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ANKRD52Q8NB46 1076 aa25.39■■□□□ 1.66
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.66
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 OBSL1O75147 1896 aa25.38■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 THAP12O43422 761 aa25.38■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FSHRP23945 695 aa25.38■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CLCN1P35523 988 aa25.38■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BCAT1P54687 386 aa25.38■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PTK2Q05397 1052 aa25.38■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRSS36Q5K4E3 855 aa25.38■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa25.38■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa25.38■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TTC30AQ86WT1 665 aa25.38■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ACP6Q9NPH0 428 aa25.38■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DENND4CQ5VZ89 1909 aa25.37■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF197O14709 1029 aa25.37■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MED7O43513 233 aa25.37■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FGF19O95750 216 aa25.37■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MYL4P12829 197 aa25.37■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLC8A3P57103 927 aa25.37■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BPIFB4P59827 614 aa25.37■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BST2Q10589 180 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLC5A9Q2M3M2 681 aa25.37■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MYRFLQ96LU7 910 aa25.37■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PNPLA8Q9NP80 782 aa25.37■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EHD2Q9NZN4 543 aa25.37■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DOCK8Q8NF50 2099 aa25.36■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MYO16Q9Y6X6 1858 aa25.36■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TNFRSF10BO14763 440 aa25.36■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MICAL2O94851 1124 aa25.36■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BMP1P13497 986 aa25.36■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SOX5P35711 763 aa25.36■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CCR2P41597 374 aa25.36■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 STAT1P42224 750 aa25.36■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLC5A3P53794 718 aa25.36■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PKDCCQ504Y2 493 aa25.36■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SARM1Q6SZW1 724 aa25.36■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NUP93Q8N1F7 819 aa25.36■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ITFG1Q8TB96 612 aa25.36■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF606Q8WXB4 792 aa25.36■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TTLL2Q9BWV7 592 aa25.36■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HHLA1C9JL84 531 aa25.35■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 M0QYV0 167 aa25.35■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SETSIPP0DME0 302 aa25.35■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GABRR2P28476 465 aa25.35■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 USP46P62068 366 aa25.35■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PLCB2Q00722 1185 aa25.35■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PDE4CQ08493 712 aa25.35■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MEA1Q16626 185 aa25.35■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FIGNQ5HY92 759 aa25.35■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLC47A2Q86VL8 602 aa25.35■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 UBA3Q8TBC4 463 aa25.35■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TCEAL4Q96EI5 215 aa25.35■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NUP58Q9BVL2 599 aa25.35■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 UBXN6Q9BZV1 441 aa25.35■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TTYH3Q9C0H2 523 aa25.35■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IL21Q9HBE4 155 aa25.35■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRKAG3Q9UGI9 489 aa25.35■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GFPT2O94808 682 aa25.34■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CDC25CP30307 473 aa25.34■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TJAP1Q5JTD0 557 aa25.34■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GAREM2Q75VX8 874 aa25.34■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SHKBP1Q8TBC3 707 aa25.34■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BAP1Q92560 729 aa25.34■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GCNAQ96QF7 691 aa25.34■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EDEM3Q9BZQ6 932 aa25.34■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 COMMD8Q9NX08 183 aa25.34■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MYO6Q9UM54 1294 aa25.34■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 USTQ9Y2C2 406 aa25.34■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ITIH6Q6UXX5 1313 aa25.34■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C5orf42Q9H799 3197 aa25.34■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 A0A1W2PRU2 124 aa25.33■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MOSPD3O75425 235 aa25.33■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CYP11B1P15538 503 aa25.33■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CEBPBP17676 345 aa25.33■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PDE6CP51160 858 aa25.33■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 OTOP3Q7RTS5 596 aa25.33■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa25.33■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PIGZQ86VD9 579 aa25.33■■□□□ 1.65
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ING5Q8WYH8 240 aa25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms