RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555542.5

PRKCH-216, Transcript of protein kinase C eta, humanhuman

TSL 4

Gene PRKCH, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCH-216ENST00000555542 MMRN2Q9H8L6 949 aa26.03■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 FANCMQ8IYD8 2048 aa26.02■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 C2orf78A6NCI8 922 aa26.02■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 MAPK13O15264 365 aa26.02■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 ABL1P00519 1130 aa26.02■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 HDCP19113 662 aa26.02■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 CCR3P51677 355 aa26.02■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 USP46P62068 366 aa26.02■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 ADAM9Q13443 819 aa26.02■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 PNOCQ13519 176 aa26.02■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 MTF1Q14872 753 aa26.02■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 NFIL3Q16649 462 aa26.02■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 FAM186BQ8IYM0 893 aa26.02■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 TAF4BQ92750 862 aa26.02■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 SLC22A12Q96S37 553 aa26.02■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 FAM83CQ9BQN1 747 aa26.02■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 B3GNT5Q9BYG0 378 aa26.02■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 RMND1Q9NWS8 449 aa26.02■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 ZSCAN32Q9NX65 697 aa26.02■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa26.02■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa26.02■■□□□ 1.76
PRKCH-216ENST00000555542 AKAP3O75969 853 aa26.01■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 NOP14P78316 857 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 PDGFRLQ15198 375 aa26.01■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 DGKKQ5KSL6 1271 aa26.01■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP26.01■■□□□ 1.755e-38■■■■■ 698.7
PRKCH-216ENST00000555542 HLA-DRAP01903 254 aa26■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 TRIM49P0CI25 452 aa26■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 TRIM49CP0CI26 452 aa26■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 IFNAR2P48551 515 aa26■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 CACNA2D1P54289 1103 aa26■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 AMPD2Q01433 879 aa26■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 CCDC150Q8NCX0 1101 aa26■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 SLITRK1Q96PX8 696 aa26■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 TTLL2Q9BWV7 592 aa26■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 SDCBP2Q9H190 292 aa26■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 HPS4Q9NQG7 708 aa26■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 ARSAP15289 507 aa25.99■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 CXCL12P48061 93 aa25.99■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 PPP3CCP48454 512 aa25.99■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 GCLMP48507 274 aa25.99■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 SPOPLQ6IQ16 392 aa25.99■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 ACOT1Q86TX2 421 aa25.99■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 FAM35AQ86V20 835 aa25.99■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 CPA6Q8N4T0 437 aa25.99■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 RIN3Q8TB24 985 aa25.99■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 SH3RF2Q8TEC5 729 aa25.99■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 GCNT4Q9P109 453 aa25.99■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 HELZP42694 1942 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 SMC2O95347 1197 aa25.98■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 ASS1P00966 412 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 NRLP54845 237 aa25.98■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 TAF10Q12962 218 aa25.98■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 USP4Q13107 963 aa25.98■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 ORC1Q13415 861 aa25.98■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 ZNF77Q15935 545 aa25.98■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 C1orf220Q5T0J3 134 aa25.98■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 Q6ZS52 159 aa25.98■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 NUP93Q8N1F7 819 aa25.98■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 SPEM1Q8N4L4 309 aa25.98■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 OSCP1Q8WVF1 389 aa25.98■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 SMARCD1Q96GM5 515 aa25.98■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 WNT6Q9Y6F9 365 aa25.98■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 PFKLP17858 780 aa25.97■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 NDST1P52848 882 aa25.97■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 SATB1Q01826 763 aa25.97■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 EDRF1Q3B7T1 1238 aa25.97■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 MAMSTRQ6ZN01 415 aa25.97■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 ATP2A3Q93084 1043 aa25.97■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 EXOC4Q96A65 974 aa25.97■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 KCNK16Q96T55 309 aa25.97■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 KRT82Q9NSB4 513 aa25.97■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 TMEM30AQ9NV96 361 aa25.97■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa25.97■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 DMDP11532 3685 aa25.97■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 ZNF840PA6NDX5 716 aa25.96■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 EPB41P11171 864 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 YWHAQP27348 245 aa25.96■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 ASPAP45381 313 aa25.96■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 PPP3CAQ08209 521 aa25.96■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 GAS6Q14393 721 aa25.96■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 ZBTB44Q8NCP5 570 aa25.96■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 SMARCE1Q969G3 411 aa25.96■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 FBXO32Q969P5 355 aa25.96■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 EEF2KMTQ96G04 330 aa25.96■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 TSG101Q99816 390 aa25.96■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 VPS13AQ96RL7 3174 aa25.96■■□□□ 1.75
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