RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552217.5

MRPL42-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L42, human

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene MRPL42, Length 920 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL42-208	ENST00000552217	APOL5	Q9BWW9	433 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	FAM50B	Q9Y247	325 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	SYNJ1	O43426	1573 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	ANO9	A1A5B4	782 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	TLR5	O60602	858 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	NXPH3	O95157	252 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	RHO	P08100	348 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	SLC5A1	P13866	664 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	PDE6C	P51160	858 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	DGKE	P52429	567 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	TFAP2B	Q92481	460 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	SERHL	Q9NQF3	203 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	EHD3	Q9NZN3	535 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	VWC2L	B2RUY7	222 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	ADM5	C9JUS6	153 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	APAF1	O14727	1248 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	PPM1D	O15297	605 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	PMM2	O15305	246 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	IL1R1	P14778	569 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	GRIA3	P42263	894 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	MAPK10	P53779	464 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	FOXF2	Q12947	444 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	DAG1	Q14118	895 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	INSC	Q1MX18	579 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	KAZN	Q674X7	775 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	CAGE1	Q8TC20	777 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPL42-208	ENST00000552217	KAT6A	Q92794	2004 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	RASSF9	O75901	435 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	CSF1R	P07333	972 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	KCNA3	P22001	575 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	ACVR2A	P27037	513 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	TBCC	Q15814	346 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	YAF2	Q8IY57	180 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	INMT	O95050	263 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	IL18RAP	O95256	599 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	ONECUT2	O95948	504 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	PCSK6	P29122	969 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPL42-208	ENST00000552217	PLA2G5	P39877	138 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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