RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 EOGTQ5NDL2 527 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 IRF7Q92985 503 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 CYFIP2Q96F07 1278 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 MTMR9Q96QG7 549 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 NAT9Q9BTE0 207 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 IL23AQ9NPF7 189 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 FANCLQ9NW38 375 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 CLDND1Q9NY35 253 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 HACD3Q9P035 362 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 BTBD7Q9P203 1132 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 PEAK1Q9H792 1746 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 CASTOR2A6NHX0 329 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 H3BMM5 538 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 GUCY1B2O75343 617 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 MLYCDO95822 493 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 CYP3A5P20815 502 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 NPTX2P47972 431 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 ELOVL2Q9NXB9 296 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 AHSPQ9NZD4 102 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 KPNA5O15131 536 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 CDC25BP30305 580 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 CUL2Q13617 745 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 NCAPHQ15003 741 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 VPS37AQ8NEZ2 397 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 AGPAT1Q99943 283 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 MTMR12Q9C0I1 747 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 TBC1D13Q9NVG8 400 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 DYRK1BQ9Y463 629 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 ITIH6Q6UXX5 1313 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 GRM5P41594 1212 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 SOX10P56693 466 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 IL9RQ01113 521 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 CNTN2Q02246 1040 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 GAD2Q05329 585 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 RFFLQ8WZ73 363 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 PAK5Q9P286 719 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 TIMM44O43615 452 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 FAM163BP0C2L3 166 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 TYMPP19971 482 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 SDHBP21912 280 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 ERVK-21P61565 698 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 HPCAP84074 193 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 PKN1Q16512 942 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 ANKRD40Q6AI12 368 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 CLEC10AQ8IUN9 316 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 TTC30BQ8N4P2 665 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 MCUR1Q96AQ8 359 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 SENP8Q96LD8 212 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 PRRX2Q99811 253 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 SMYD2Q9NRG4 433 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 LATS2Q9NRM7 1088 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 FAM105AQ9NUU6 356 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 HEY1Q9Y5J3 304 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 LTN1O94822 1766 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 GSTA4O15217 222 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 AOC2O75106 756 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 RANBP1P43487 201 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 NRLP54845 237 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 BBS9Q3SYG4 887 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 MMGT1Q8N4V1 131 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 PORCNQ9H237 461 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 SEPT3Q9UH03 358 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 MRC1P22897 1456 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 EPHB2P29323 1055 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 ELP6Q0PNE2 266 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 FAM47EQ6ZV65 393 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 STOX1Q6ZVD7 989 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 USP45Q70EL2 814 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 OTOP2Q7RTS6 562 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 MIB1Q86YT6 1006 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 HSFY1Q96LI6 401 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 GAD1Q99259 594 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 SNTG2Q9NY99 539 aa8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms