RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543088.5

TM7SF3-212, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 4

Gene TM7SF3, Length 601 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-212ENST00000543088 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa26.56■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 BICDL2A1A5D9 508 aa26.55■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 CLDN5O00501 218 aa26.55■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 CKMP06732 381 aa26.55■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 USP17L7P0C7H9 530 aa26.55■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 PFKLP17858 780 aa26.55■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 PMS1P54277 932 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 INCA1Q0VD86 236 aa26.55■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 ANGPT1Q15389 498 aa26.55■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 TTC39CQ8N584 583 aa26.55■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 SLITRK1Q96PX8 696 aa26.55■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP26.55■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa26.55■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 COL4A3Q01955 1670 aa26.54■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 MORC3Q14149 939 aa26.54■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 WDR44Q5JSH3 913 aa26.54■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 KLHL10Q6JEL2 608 aa26.54■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 CRYBG2Q8N1P7 616 aa26.54■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 CEP63Q96MT8 703 aa26.54■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 NT5C1AQ9BXI3 368 aa26.54■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 KRT82Q9NSB4 513 aa26.54■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 RAB20Q9NX57 234 aa26.54■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 CACNA1HO95180 2353 aa26.53■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 TARSP26639 723 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 FOXR2Q6PJQ5 311 aa26.53■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 NUP93Q8N1F7 819 aa26.53■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 FAM3CQ92520 227 aa26.53■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 LRRC3BQ96PB8 259 aa26.53■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 HMGXB4Q9UGU5 601 aa26.53■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 BIN1O00499 593 aa26.52■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 LRRN2O75325 713 aa26.52■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 AP1G2O75843 785 aa26.52■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 CACNA2D1P54289 1103 aa26.52■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 USP46P62068 366 aa26.52■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 TRIML1Q8N9V2 468 aa26.52■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 PDZD8Q8NEN9 1154 aa26.52■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 NELFBQ8WX92 580 aa26.52■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 ZFYVE19Q96K21 471 aa26.52■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 FAM86C1Q9NVL1 165 aa26.52■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 CCL26Q9Y258 94 aa26.52■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
TM7SF3-212ENST00000543088 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa26.51■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 CCDC130P13994 396 aa26.51■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 CD44P16070 742 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 CD58P19256 250 aa26.51■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 RPS9P46781 194 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 ORC1Q13415 861 aa26.51■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 CCDC40Q4G0X9 1142 aa26.51■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 FRMD5Q7Z6J6 570 aa26.51■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa26.51■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 C1orf210Q8IVY1 113 aa26.51■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 FUKQ8N0W3 1084 aa26.51■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 SLC2A14Q8TDB8 520 aa26.51■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 FAM49BQ9NUQ9 324 aa26.51■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 TMEM30AQ9NV96 361 aa26.51■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 CTNND2Q9UQB3 1225 aa26.51■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 CILPO75339 1184 aa26.5■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 HDCP19113 662 aa26.5■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 YWHAQP27348 245 aa26.5■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 PAK1Q13153 545 aa26.5■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa26.5■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 OVCA2Q8WZ82 227 aa26.5■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 SEMA4DQ92854 862 aa26.5■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 CLDN23Q96B33 292 aa26.5■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 COMMD8Q9NX08 183 aa26.5■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 GTSE1Q9NYZ3 720 aa26.5■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 C2orf78A6NCI8 922 aa26.49■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa26.49■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 FAM200BP0CF97 657 aa26.49■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 MRE11P49959 708 aa26.49■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 TAF10Q12962 218 aa26.49■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 CBWD6Q4V339 395 aa26.49■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 CBWD3Q5JTY5 395 aa26.49■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 CBWD5Q5RIA9 395 aa26.49■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 TTI2Q6NXR4 508 aa26.49■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 PAQR9Q6ZVX9 377 aa26.49■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 FBXO32Q969P5 355 aa26.49■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 SLC35C1Q96A29 364 aa26.49■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 KCNK16Q96T55 309 aa26.49■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 IER2Q9BTL4 223 aa26.49■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 GKN1Q9NS71 199 aa26.49■■□□□ 1.83
TM7SF3-212ENST00000543088 GCNT4Q9P109 453 aa26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms