RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539921.5

SNHG1-211, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG1, Length 1,071 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG1-211ENST00000539921 GALNT3Q14435 633 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF846Q147U1 533 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 TLR1Q15399 786 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 NTRK3Q16288 839 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 SFT2D3Q587I9 215 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 C1orf146Q5VVC0 180 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 NANOGP8Q6NSW7 305 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 RAPH1Q70E73 1250 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 PODNQ7Z5L7 613 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 OSTM1Q86WC4 334 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 TRIM22Q8IYM9 498 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 NDUFAF2Q8N183 169 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 SIX5Q8N196 739 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 NATD1Q8N6N6 113 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 METTL13Q8N6R0 699 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 SLC4A11Q8NBS3 891 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 TSPAN14Q8NG11 270 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 GSDMBQ8TAX9 411 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 FBXO25Q8TCJ0 367 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 DTX3LQ8TDB6 740 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 ACTRT2Q8TDY3 377 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 GDPD5Q8WTR4 605 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 DLG3Q92796 817 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 P2RX5Q93086 422 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 TTC17Q96AE7 1141 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 APOPT1Q96IL0 206 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 FAR2Q96K12 515 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 FAM161BQ96MY7 647 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 PANX3Q96QZ0 392 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 TRIM15Q9C019 465 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 FAM96AQ9H5X1 160 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 SLA2Q9H6Q3 261 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 DNAJC18Q9H819 358 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 FANCEQ9HB96 536 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 HMG20AQ9NP66 347 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 SEC31BQ9NQW1 1179 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 C8orf4Q9NR00 106 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 PNPLA3Q9NST1 481 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 SLC39A1Q9NY26 324 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 MBD2Q9UBB5 411 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 SLC7A8Q9UHI5 535 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 NENFQ9UMX5 172 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 PSMD13Q9UNM6 376 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 TFR2Q9UP52 801 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 SPEF1Q9Y4P9 236 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF804BA4D1E1 1349 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 ATRNO75882 1429 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 LRP6O75581 1613 aa6.39□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa6.38□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 LRRC53A6NM62 1247 aa6.38□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 CAPN14A8MX76 684 aa6.38□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 MTSS1O43312 755 aa6.38□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 BUB1O43683 1085 aa6.38□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 DTNBO60941 627 aa6.38□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 FAM155BO75949 473 aa6.38□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 DNAJB5O75953 348 aa6.38□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 PLEKHA8P1O95397 391 aa6.38□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 DEXIO95424 95 aa6.38□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 H6PDO95479 791 aa6.38□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 FTCDO95954 541 aa6.38□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 PAHP00439 452 aa6.38□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 GSTM1P09488 218 aa6.38□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 DDX5P17844 614 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 ITIH2P19823 946 aa6.38□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 IMPDH1P20839 514 aa6.38□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 AMPD1P23109 780 aa6.38□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 PON1P27169 355 aa6.38□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 PTGIRP43119 386 aa6.38□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SNHG1-211ENST00000539921 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
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