RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 MZT2BQ6NZ67 158 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 FAM180BQ6P0A1 224 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 BTNL9Q6UXG8 535 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 USP51Q70EK9 711 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 KCNK18Q7Z418 384 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRC-214ENST00000530727 ZNF480Q8WV37 535 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRC-214ENST00000530727 APOL5Q9BWW9 433 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 RIC8AQ9NPQ8 531 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRC-214ENST00000530727 CCDC149Q6ZUS6 474 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 CHD1LQ86WJ1 897 aa4.74□□□□□ -1.65
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PTPRC-214ENST00000530727 PDCD2LQ9BRP1 358 aa4.74□□□□□ -1.65
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PTPRC-214ENST00000530727 HTR3DQ70Z44 454 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRC-214ENST00000530727 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 SLC16A11Q8NCK7 471 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRC-214ENST00000530727 GPR156Q8NFN8 814 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 DEPTORQ8TB45 409 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 PPM1MQ96MI6 270 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 GREM2Q9H772 168 aa4.73□□□□□ -1.65
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