RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526317.5

CSRP1-208, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, human

TSL 3

Gene CSRP1, Length 374 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSRP1-208	ENST00000526317	ASB16	Q96NS5	453 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	DUSP16	Q9BY84	665 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	TASP1	Q9H6P5	420 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	SIX2	Q9NPC8	291 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	IL37	Q9NZH6	218 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	GCNT4	Q9P109	453 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	SMTNL1	A8MU46	457 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	HHLA1	C9JL84	531 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	FAM200B	P0CF97	657 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	VDR	P11473	427 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	ZNF18	P17022	549 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	VIPR2	P41587	438 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	ZNF165	P49910	485 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	MFAP3	P55082	362 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	IQCB1	Q15051	598 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	MTSS1L	Q765P7	747 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	MON1A	Q86VX9	555 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	SMARCD2	Q92925	531 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	KRT82	Q9NSB4	513 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	COMMD8	Q9NX08	183 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	EHD2	Q9NZN4	543 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	SOBP	A7XYQ1	873 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	ECI2	O75521	394 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	TADA3	O75528	432 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	CALCA	P01258	141 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	PAEP	P09466	180 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	CD19	P15391	556 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	FCAR	P24071	287 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	YWHAQ	P27348	245 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	WEE1	P30291	646 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	GPC5	P78333	572 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	TAF10	Q12962	218 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	CNGA2	Q16280	664 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	SGO2	Q562F6	1265 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	TXNDC8	Q6A555	127 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	TFAP2B	Q92481	460 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	FAM81B	Q96LP2	452 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	GCNA	Q96QF7	691 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	KXD1	Q9BQD3	176 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	FAM92A	A1XBS5	289 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CSRP1-208	ENST00000526317	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CSRP1-208	ENST00000526317	BECN2	A8MW95	431 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CSRP1-208	ENST00000526317	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
CSRP1-208	ENST00000526317	TPM2	P07951	284 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CSRP1-208	ENST00000526317	KRT5	P13647	590 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CSRP1-208	ENST00000526317	NPR3	P17342	541 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CSRP1-208	ENST00000526317	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	11.08	□□□□□ -0.64
CSRP1-208	ENST00000526317	PPP3CC	P48454	512 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CSRP1-208	ENST00000526317	ZNF132	P52740	706 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CSRP1-208	ENST00000526317	SLC5A3	P53794	718 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CSRP1-208	ENST00000526317	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
CSRP1-208	ENST00000526317	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CSRP1-208	ENST00000526317	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CSRP1-208	ENST00000526317	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		11.08	□□□□□ -0.64

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