RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 CIAO1O76071 339 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 GTF2H3Q13889 308 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 CSRP2Q16527 193 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 TMPRSS6Q8IU80 811 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 PLXDC1Q8IUK5 500 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 CHPFQ8IZ52 775 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 IFI44Q8TCB0 444 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 CLPTM1LQ96KA5 538 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 KLHL42Q9P2K6 505 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 CLRN2A0PK11 232 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 SLC16A6O15403 523 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 OFD1O75665 1012 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 SCGB1D2O95969 90 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 SLC5A1P13866 664 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 RARSP54136 660 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 ATAT1Q5SQI0 421 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 GADL1Q6ZQY3 521 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 CATIPQ7Z7H3 387 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 OR10H5Q8NGA6 315 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 HPS3Q969F9 1004 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 RAB24Q969Q5 203 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 TEKT1Q969V4 418 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 PGBD4Q96DM1 585 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 DMRTA2Q96SC8 542 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 NDC1Q9BTX1 674 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 VEZTQ9HBM0 779 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 SLC23A1Q9UHI7 598 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-225ENST00000515835 SSC5DA1L4H1 1573 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 POMCP01189 267 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 AMHP03971 560 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 GNAI3P08754 354 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 IL15P40933 162 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 CREMQ03060 361 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 TLE1Q04724 770 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 MTX1Q13505 466 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 PRKG1Q13976 671 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 PGS1Q32NB8 556 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 FAM102BQ5T8I3 360 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 NXNQ6DKJ4 435 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 RNF207Q6ZRF8 634 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 ATG9AQ7Z3C6 839 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 C1orf210Q8IVY1 113 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 TPH2Q8IWU9 490 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 IL17DQ8TAD2 202 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 KLHDC4Q8TBB5 520 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 EXTL1Q92935 676 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 MVB12AQ96EY5 273 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 MAP3K14Q99558 947 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 MAN1C1Q9NR34 630 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 TMOD2Q9NZR1 351 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 POLHQ9Y253 713 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 AOX1Q06278 1338 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 SALL1Q9NSC2 1324 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 SPEF2Q9C093 1822 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 TSPAN6O43657 245 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 ALAS1P13196 640 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 RAP2BP61225 183 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 LRRC41Q15345 812 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 NRN1LQ496H8 165 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF529Q6P280 563 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 RNF169Q8NCN4 708 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 MYOCQ99972 504 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 GRXCR1A8MXD5 290 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 TCP10L2B9ZVM9 353 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 TRIM24O15164 1050 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 ARIH2O95376 493 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 LPOP22079 712 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 KRTAP10-2P60368 255 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 UBXN2BQ14CS0 331 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-225ENST00000515835 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
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