RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-225ENST00000513069 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 NPR3P17342 541 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 ANXA13P27216 316 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 ADORA2BP29275 332 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 MAP3K7CLP57077 242 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 GRM2Q14416 872 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 CLEC20AQ6ZU45 233 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 RRAGAQ7L523 313 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 CMTM8Q8IZV2 173 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 NUP93Q8N1F7 819 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 MAB21L3Q8N8X9 362 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 PBXIP1Q96AQ6 731 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 KREMEN1Q96MU8 473 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC22A12Q96S37 553 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 CYP2S1Q96SQ9 504 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 CRACR2AQ9BSW2 395 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 GCNT4Q9P109 453 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM92AA1XBS5 289 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 C2orf78A6NCI8 922 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF840PA6NDX5 716 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 SOBPA7XYQ1 873 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC9A1P19634 815 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 PGFP49763 221 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 APBA1Q02410 837 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 CETN1Q12798 172 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 TAF10Q12962 218 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 ARHGAP17Q68EM7 881 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 SASS6Q6UVJ0 657 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 MFSD6LQ8IWD5 586 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 PPM1KQ8N3J5 372 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 RIN3Q8TB24 985 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 GCNAQ96QF7 691 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 ZSWIM1Q9BR11 485 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 ANO10Q9NW15 660 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 CCL26Q9Y258 94 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 ATP8B3O60423 1300 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 GREB1Q4ZG55 1949 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 SHISA7A6NL88 538 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 ARNTLO00327 626 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM200BP0CF97 657 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 PSMC3P17980 439 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC5A3P53794 718 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 GCNT1Q02742 428 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 MAN2A1Q16706 1144 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 CDKAL1Q5VV42 579 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 GJB7Q6PEY0 223 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 TRIM65Q6PJ69 517 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 SIX5Q8N196 739 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 TFAP2BQ92481 460 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 DUSP16Q9BY84 665 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 CNTN6Q9UQ52 1028 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-225ENST00000513069 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 KCNJ18B7U540 433 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 CALCAP01258 141 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 PON1P27169 355 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 YWHAQP27348 245 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF132P52740 706 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 ZXDBP98169 803 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 TYRO3Q06418 890 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 FCHO2Q0JRZ9 810 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 KCNJ12Q14500 433 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 NCAPHQ15003 741 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 STX1AQ16623 288 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 VWA3BQ502W6 1294 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 TCP11X2Q5H9J9 407 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 TMEM270Q6UE05 265 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 TTC30AQ86WT1 665 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM114A1Q8IWE2 563 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 FBXL6Q8N531 539 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 E2F7Q96AV8 911 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 RNF38Q9H0F5 515 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 HSD3B7Q9H2F3 369 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 NDST4Q9H3R1 872 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 SIX2Q9NPC8 291 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 FANCLQ9NW38 375 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 OBP2AQ9NY56 170 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 ZMYM5Q9UJ78 669 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 FBXL21Q9UKT6 434 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 CA14Q9ULX7 337 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-225ENST00000513069 GDI1P31150 447 aa16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms