RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 HOXD1Q9GZZ0 328 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM245Q9H330 911 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 SNX7Q9UNH6 387 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 MED16Q9Y2X0 877 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 WDR17Q8IZU2 1322 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 SNAPINO95295 136 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 PGM3O95394 542 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 PSMG1O95456 288 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 HOXA6P31267 233 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 NPY2RP49146 381 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 NPEPPSP55786 919 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 CCNA1P78396 465 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 TSC22D1Q15714 1073 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 BNIPLQ7Z465 357 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ADCK1Q86TW2 530 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 FITM2Q8N6M3 262 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 CATSPER1Q8NEC5 780 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ENGASEQ8NFI3 743 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 POMGNT1Q8WZA1 660 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 OR2B2Q9GZK3 357 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM168Q9H0V1 697 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 NARFLQ9H6Q4 476 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 PLSCR2Q9NRY7 297 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 KBTBD4Q9NVX7 518 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 EID1Q9Y6B2 187 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ATP10BO94823 1461 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 C16orf96A6NNT2 1141 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 EVPLLA8MZ36 301 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 LRRN2O75325 713 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 SURF6O75683 361 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 MYO1DO94832 1006 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 CCNDBP1O95273 360 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 SNAP29O95721 258 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 TFAP2AP05549 437 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 WEE2P0C1S8 567 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 CPB1P15086 417 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 PLCG1P19174 1290 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ITGALP20701 1170 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 HARS2P49590 506 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 VASPP50552 380 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 KRT17Q04695 432 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 KRT81Q14533 505 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 SPATS1Q496A3 300 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 BEND3Q5T5X7 828 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 C1orf146Q5VVC0 180 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 RNF43Q68DV7 783 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF425Q6IV72 752 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 KRT74Q7RTS7 529 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 KRT26Q7Z3Y9 468 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 MARC2Q969Z3 335 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 MARVELD3Q96A59 401 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 THAP11Q96EK4 314 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 B3GALT6Q96L58 329 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 AK8Q96MA6 479 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 KATNAL1Q9BW62 490 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 HSD3B7Q9H2F3 369 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 GDF3Q9NR23 364 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 SACM1LQ9NTJ5 587 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ERGIC3Q9Y282 383 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 AXIN2Q9Y2T1 843 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 TOR1AO14656 332 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ATG13O75143 517 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 TBX10O75333 385 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 CAPNS1P04632 268 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 NR3C2P08235 984 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ACTN1P12814 892 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 NPR1P16066 1061 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ACSL1P33121 698 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ARFIP1P53367 373 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 DLG4P78352 724 aa6.43□□□□□ -1.38
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