RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
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SH3BP2-209ENST00000504450 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 GRIN2DO15399 1336 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa11.34□□□□□ -0.59
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SH3BP2-209ENST00000504450 LIASO43766 372 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 TJP3O95049 919 aa11.34□□□□□ -0.59
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SH3BP2-209ENST00000504450 KRT14P02533 472 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 CHRNA1P02708 482 aa11.34□□□□□ -0.59
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SH3BP2-209ENST00000504450 GPD1P21695 349 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 WARSP23381 471 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 KLRC2P26717 231 aa11.34□□□□□ -0.59
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SH3BP2-209ENST00000504450 PPP1R7Q15435 360 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 HADHQ16836 314 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 TFDP3Q5H9I0 405 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 CEP85LQ5SZL2 805 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 AGBL2Q5U5Z8 902 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 OLFML1Q6UWY5 402 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa11.34□□□□□ -0.59
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SH3BP2-209ENST00000504450 DPH6Q7L8W6 267 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 OSTM1Q86WC4 334 aa11.34□□□□□ -0.59
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SH3BP2-209ENST00000504450 GSTCDQ8NEC7 633 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 OR6B3Q8NGW1 331 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC35B2Q8TB61 432 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF560Q96MR9 790 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 CNPY3Q9BT09 278 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM109Q9BVC6 243 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 C11orf49Q9H6J7 331 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 SYNCQ9H7C4 482 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 KLHL11Q9NVR0 708 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 ASNSD1Q9NWL6 643 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-209ENST00000504450 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
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SH3BP2-209ENST00000504450 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa11.33□□□□□ -0.6
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SH3BP2-209ENST00000504450 TULP2O00295 520 aa11.33□□□□□ -0.6
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SH3BP2-209ENST00000504450 SCNN1AP37088 669 aa11.33□□□□□ -0.6
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SH3BP2-209ENST00000504450 CAV1Q03135 178 aa11.33□□□□□ -0.6
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SH3BP2-209ENST00000504450 PDE4CQ08493 712 aa11.33□□□□□ -0.6
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SH3BP2-209ENST00000504450 OASLQ15646 514 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
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SH3BP2-209ENST00000504450 OR6B2Q6IFH4 312 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP2-209ENST00000504450 BBS12Q6ZW61 710 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
SH3BP2-209ENST00000504450 RSPH3Q86UC2 560 aa11.33□□□□□ -0.6
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SH3BP2-209ENST00000504450 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa11.33□□□□□ -0.6
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SH3BP2-209ENST00000504450 TRIP11Q15643 1979 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRD1A4D1F6 860 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-209ENST00000504450 A8MXQ7 604 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-209ENST00000504450 M0QZ92 97 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-209ENST00000504450 DLL1O00548 723 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-209ENST00000504450 GABRDO14764 452 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-209ENST00000504450 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-209ENST00000504450 HCRTO43612 131 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-209ENST00000504450 LMO2P25791 158 aa11.32□□□□□ -0.6
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