RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503393.6

SH3BP2-207, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-207ENST00000503393 POLIQ9UNA4 740 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 HPS5Q9UPZ3 1129 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 RBP5P82980 135 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 FAM45BPQ6NSW5 357 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 ELMOD1Q8N336 334 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 WDR60Q8WVS4 1066 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 SPATA2Q9UM82 520 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 KRT6BP04259 564 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 KRT6CP48668 564 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 ACAD10Q6JQN1 1059 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 BNIPLQ7Z465 357 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 TBKBP1A7MCY6 615 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 PTENP60484 403 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 PDZK1Q5T2W1 519 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 SYNE4Q8N205 404 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 PGK2P07205 417 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 HSMCR30P0CW71 290 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 KCNT1Q5JUK3 1230 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 CYLDQ9NQC7 956 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 FAM196BA6NMK8 535 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 OLFM1Q99784 485 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 ABCA8O94911 1581 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 SASH3O75995 380 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 TMC3Q7Z5M5 1100 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 UNC45BQ8IWX7 931 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 PTPN7P35236 360 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 CCDC80Q76M96 950 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 TRPC7Q9HCX4 862 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 CACHD1Q5VU97 1274 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 KCNV1Q6PIU1 500 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 TMEM237Q96Q45 408 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 ACAD9Q9H845 621 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 C2CD2Q9Y426 696 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 TMEM132DQ14C87 1099 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 FUT11Q495W5 492 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 MASTLQ96GX5 879 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 PAFAH2Q99487 392 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 GGA2Q9UJY4 613 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 PON1P27169 355 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 KLHL12Q53G59 568 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 ITSN1Q15811 1721 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 AHCYL1O43865 530 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 TRIQKQ629K1 86 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 CIAPIN1Q6FI81 312 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 FBXO36Q8NEA4 188 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 SEPT1Q8WYJ6 367 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 PSMC6P62333 389 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 BFSP2Q13515 415 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 NDUFA5Q16718 116 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 A0A087WXM4 84 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 SOAT2O75908 522 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 ATP4AP20648 1035 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 ATP6V1B2P21281 511 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 EPHB2P29323 1055 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 OR6Y1Q8NGX8 325 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 LACRTQ9GZZ8 138 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 MTMR4Q9NYA4 1195 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 SDR42E2A6NKP2 422 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 MYL3P08590 195 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 ZNF844Q08AG5 666 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 PDPK2PQ6A1A2 396 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 KLHL31Q9H511 634 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 PRR36Q9H6K5 1346 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 CSPG5O95196 566 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 NT5C1AQ9BXI3 368 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 HERVK_113P62684 666 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 ZNF543Q08ER8 600 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 ARMC3Q5W041 872 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 APPL2Q8NEU8 664 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 CENPXA8MT69 81 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 TRIM65Q6PJ69 517 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-207ENST00000503393 VTA1Q9NP79 307 aa16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms