RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498280.1

RBM39-242, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 444 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-242ENST00000498280 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa3.07□□□□□ -1.92
RBM39-242ENST00000498280 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP3.07□□□□□ -1.92
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RBM39-242ENST00000498280 FPR3P25089 353 aa3.06□□□□□ -1.92
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RBM39-242ENST00000498280 GNAI1P63096 354 aa3.06□□□□□ -1.92
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RBM39-242ENST00000498280 DLK2Q6UY11 383 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-242ENST00000498280 PRR18Q8N4B5 295 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-242ENST00000498280 LRRC71Q8N4P6 559 aa3.06□□□□□ -1.92
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RBM39-242ENST00000498280 MAP3K14Q99558 947 aa3.06□□□□□ -1.92
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RBM39-242ENST00000498280 FSD1LQ9BXM9 530 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-242ENST00000498280 RLIMQ9NVW2 624 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-242ENST00000498280 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RBM39-242ENST00000498280 OBP2AQ9NY56 170 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-242ENST00000498280 GABBR1Q9UBS5 961 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-242ENST00000498280 ABCF2Q9UG63 623 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-242ENST00000498280 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RBM39-242ENST00000498280 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
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RBM39-242ENST00000498280 FAM90A10PA6NDY2 464 aa3.05□□□□□ -1.92
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RBM39-242ENST00000498280 KRT86O43790 486 aa3.05□□□□□ -1.92
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RBM39-242ENST00000498280 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
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RBM39-242ENST00000498280 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
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RBM39-242ENST00000498280 HESX1Q9UBX0 185 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-242ENST00000498280 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RBM39-242ENST00000498280 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-242ENST00000498280 A6NNZ2 444 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-242ENST00000498280 ERVV-2B6SEH9 535 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-242ENST00000498280 PRC1O43663 620 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-242ENST00000498280 SOAT2O75908 522 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-242ENST00000498280 PRF1P14222 555 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-242ENST00000498280 ADORA2AP29274 412 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-242ENST00000498280 MAP2K6P52564 334 aa3.04□□□□□ -1.92
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RBM39-242ENST00000498280 AWAT1Q58HT5 328 aa3.04□□□□□ -1.92
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