RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	OBP2A	Q9NY56	170 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	ASB3	Q9Y575	518 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	GNB5	O14775	395 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	SOAT2	O75908	522 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP3K6	O95382	1288 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	CTDNEP1	O95476	244 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	PRAMEF12	O95522	483 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	CAVIN2	O95810	425 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	DGKG	P49619	791 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP4F8	P98187	520 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	SPAG1	Q07617	926 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR17	Q13304	367 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF174	Q15697	407 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	PLK5	Q496M5	336 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	SEZ6	Q53EL9	994 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	NECAB1	Q8N987	351 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMG2	Q969U7	264 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	HHIP	Q96QV1	700 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC3	Q9BY71	257 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	TASP1	Q9H6P5	420 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	GKN1	Q9NS71	199 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	COL4A2	P08572	1712 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFRSF10B	O14763	440 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	GIPC1	O14908	333 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	HIP1R	O75146	1068 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	OAZ2	O95190	189 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	NFKB1	P19838	968 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	SPINK2	P20155	84 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	MUT	P22033	750 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	CDC25C	P30307	473 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	AVPR1A	P37288	418 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	GSK3A	P49840	483 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	BFSP1	Q12934	665 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMD2	Q13200	908 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	11.74	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	CENPP	Q6IPU0	288 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	GAREM2	Q75VX8	874 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC16	Q8NEE8	873 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	BEST2	Q8NFU1	509 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	DRC1	Q96MC2	740 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	MTMR11	A4FU01	709 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511		M0QZQ0	153 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC16A4	O15374	487 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	CLDN3	O15551	220 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	CXCL8	P10145	99 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	ODC1	P11926	461 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	DGKE	P52429	567 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	GUCY1B3	Q02153	619 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	RUNX3	Q13761	415 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	MYBPC2	Q14324	1141 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	BICD1	Q96G01	975 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	EBF3	Q9H4W6	596 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	SEPT3	Q9UH03	358 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	DNM3	Q9UQ16	869 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	DCLK1	O15075	740 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	TOM1L1	O75674	476 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	VNN2	O95498	520 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	APBB3	O95704	486 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	EGF	P01133	1207 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	DRD1	P21728	446 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	PROZ	P22891	400 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SKAP2-209	ENST00000497511	CDR1	P51861	262 aa		11.72	□□□□□ -0.53

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms