RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 NFS1Q9Y697 457 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 STYXL1Q9Y6J8 313 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 EVPLQ92817 2033 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 ENO4A6NNW6 628 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 NBNO60934 754 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 MAFO75444 373 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 DGKIO75912 1065 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 MTA2O94776 668 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 KIAA0754O94854 1291 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 FGFR4P22455 802 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 COILP38432 576 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 RFC5P40937 340 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 BPIFB4P59827 614 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 ADAM15Q13444 863 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 EEF1DP3Q658K8 133 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 ZDHHC24Q6UX98 284 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 CCDC114Q96M63 670 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 S1PR5Q9H228 398 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 SEMA4AQ9H3S1 761 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 RXFP1Q9HBX9 757 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 TMEM39AQ9NV64 488 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 ASIC3Q9UHC3 531 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
HERC4-211ENST00000492996 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 FAM187AA6NFU0 413 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 NDUFAB1O14561 156 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 TOM1L1O75674 476 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 AMHP03971 560 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 FAM163BP0C2L3 166 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 CDR1P51861 262 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 TAS2R40P59535 323 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 CLDN10P78369 228 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 TRPC3Q13507 836 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 MTMR3Q13615 1198 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 PPP2R5EQ16537 467 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 PRUNE1Q86TP1 453 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 CD302Q8IX05 232 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 TMEM192Q8IY95 271 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 ZNF606Q8WXB4 792 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 SEC14L1Q92503 715 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 HIPK3Q9H422 1215 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 GRHL1Q9NZI5 618 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 MYO16Q9Y6X6 1858 aa7.4□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 C2orf16Q68DN1 1984 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 RPSAP08865 295 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 RALAP11233 206 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 CD19P15391 556 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 TCF4P15884 667 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 CTNNA2P26232 953 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 PMS2P54278 862 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 NOMO3P69849 1222 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 SLC29A2Q14542 456 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 MBTPS1Q14703 1052 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 ZNF568Q3ZCX4 644 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 C9orf50Q5SZB4 431 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 LIN9Q5TKA1 542 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 KAZNQ674X7 775 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 DPH6Q7L8W6 267 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 TRIM74Q86UV6 250 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 TRIM73Q86UV7 250 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 BRSK2Q8IWQ3 736 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 OR6J1Q8NGC5 347 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 SLC22A17Q8WUG5 538 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.232e-6■□□□□ 10.9
HERC4-211ENST00000492996 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 MINDY3Q9H8M7 445 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 FAM169AQ9Y6X4 670 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 MAGEB2O15479 319 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 ECEL1O95672 775 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 PIGRP01833 764 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 TMEM191BP0C7N4 346 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 LSP1P33241 339 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 ABCD1P33897 745 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 RAP1GAPP47736 663 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 CENPCQ03188 943 aa7.39□□□□□ -1.23
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