RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491123.5

SUCLG1-208, Transcript of succinate-CoA ligase alpha subunit, human

TSL 3

Gene SUCLG1, Length 1,073 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUCLG1-208	ENST00000491123	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	MKS1	Q9NXB0	559 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	C4orf47	A7E2U8	309 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	CYP1B1	Q16678	543 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	6.11	□□□□□ -1.43	5e-7	■■■□□ 16.6
SUCLG1-208	ENST00000491123	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	MMS19	Q96T76	1030 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	KLHL33	A6NCF5	533 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	T-ENOL	P0DO92	83 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	BTBD19	C9JJ37	291 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	E2F2	Q14209	437 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	IQCB1	Q15051	598 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZNF585B	Q52M93	769 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	POLH	Q9Y253	713 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SUCLG1-208	ENST00000491123	KRTAP5-9	P26371	169 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	E2F1	Q01094	437 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	ID2	Q02363	134 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	CPA6	Q8N4T0	437 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	CNTD1	Q8N815	330 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	WDCP	Q9H6R7	721 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	AP4M1	O00189	453 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	ARIH2	O95376	493 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	AHSG	P02765	367 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	PRKCB	P05771	671 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	CSF1R	P07333	972 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	CFHR1	Q03591	330 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	SEC23B	Q15437	767 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	AWAT1	Q58HT5	328 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	CCDC17	Q96LX7	622 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	TEKT5	Q96M29	485 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	SLC28A2	O43868	658 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	TULP3	O75386	442 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	GCAT	O75600	419 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	PSG6	Q00889	435 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	PRR25	Q96S07	402 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	ABCF2	Q9UG63	623 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	TBX22	Q9Y458	520 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	MT-CO1	P00395	513 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	FGA	P02671	866 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	CTSA	P10619	480 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	NOG	Q13253	232 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	LY6K	Q17RY6	165 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZPBP	Q9BS86	351 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	VNN1	O95497	513 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	TNFRSF1B	P20333	461 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	PDE6C	P51160	858 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	ATG9B	Q674R7	924 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	MT-CO3	P00414	261 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	TGFB3	P10600	412 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	ADORA2A	P29274	412 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	HK3	P52790	923 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
SUCLG1-208	ENST00000491123	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		6.03	□□□□□ -1.44

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