RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489977.5

SKAP2-206, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 679 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-206ENST00000489977 CADPSQ9ULU8 1353 aa4.76□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 AP4M1O00189 453 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 SOCS2O14508 198 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 INSIG1O15503 277 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 DLDP09622 509 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 KCNA3P22001 575 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 CCKBRP32239 447 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 DGKEP52429 567 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 PSG6Q00889 435 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 E2F1Q01094 437 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 KLHL22Q53GT1 634 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 ZNF813Q6ZN06 617 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 SLC15A3Q8IY34 581 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 C16orf52Q8NHV5 167 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 PIGOQ8TEQ8 1089 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 HPS3Q969F9 1004 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 PRR25Q96S07 402 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 ARMT1Q9H993 441 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 TMX2Q9Y320 296 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 SNX14Q9Y5W7 946 aa4.75□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 USP1O94782 785 aa4.74□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 FGBP02675 491 aa4.74□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 PRKCBP05771 671 aa4.74□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 THP07101 528 aa4.74□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 RAPGEF1Q13905 1077 aa4.74□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 FAM187BQ17R55 369 aa4.74□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 ATAT1Q5SQI0 421 aa4.74□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa4.74□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa4.74□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa4.74□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 IZUMO1Q8IYV9 350 aa4.74□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 ZNF398Q8TD17 642 aa4.74□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 FAM118BQ9BPY3 351 aa4.74□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 TCF7L1Q9HCS4 588 aa4.74□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 CPA4Q9UI42 421 aa4.74□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 ZNF580Q9UK33 172 aa4.74□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa4.74□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 ADAM10O14672 748 aa4.73□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 A1BGP04217 495 aa4.73□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 CYP2C9P11712 490 aa4.73□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 WNT3P56703 355 aa4.73□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 GAS2L3Q86XJ1 694 aa4.73□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa4.73□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 VCPIP1Q96JH7 1222 aa4.73□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 EFHD1Q9BUP0 239 aa4.73□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 EBF3Q9H4W6 596 aa4.73□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 A0A087WWL8 130 aa4.72□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 A0A088AWK7 358 aa4.72□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa4.72□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 UBE2Q2LH0YL09 131 aa4.72□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 FGAP02671 866 aa4.72□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 SNHG28P0DPA3 235 aa4.72□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 TKTP29401 623 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 PLCD1P51178 756 aa4.72□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 ARFIP2P53365 341 aa4.72□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 PTCHD3Q3KNS1 767 aa4.72□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 SHC4Q6S5L8 630 aa4.72□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa4.72□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 CHMP4CQ96CF2 233 aa4.72□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 RSPRY1Q96DX4 576 aa4.72□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 BRIP1Q9BX63 1249 aa4.72□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa4.72□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 STAP2Q9UGK3 403 aa4.72□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 LRP12Q9Y561 859 aa4.72□□□□□ -1.65
SKAP2-206ENST00000489977 DSCR3O14972 297 aa4.71□□□□□ -1.66
SKAP2-206ENST00000489977 PRF1P14222 555 aa4.71□□□□□ -1.66
SKAP2-206ENST00000489977 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
SKAP2-206ENST00000489977 RAB1AP62820 205 aa4.71□□□□□ -1.66
SKAP2-206ENST00000489977 KRT17Q04695 432 aa4.71□□□□□ -1.66
SKAP2-206ENST00000489977 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
SKAP2-206ENST00000489977 TWIST1Q15672 202 aa4.71□□□□□ -1.66
SKAP2-206ENST00000489977 C10orf25Q5T742 122 aa4.71□□□□□ -1.66
SKAP2-206ENST00000489977 PIP4P1Q86T03 277 aa4.71□□□□□ -1.66
SKAP2-206ENST00000489977 SFTPA1Q8IWL2 248 aa4.71□□□□□ -1.66
SKAP2-206ENST00000489977 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa4.71□□□□□ -1.66
SKAP2-206ENST00000489977 SLC15A4Q8N697 577 aa4.71□□□□□ -1.66
SKAP2-206ENST00000489977 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
SKAP2-206ENST00000489977 TMEM171Q8WVE6 324 aa4.71□□□□□ -1.66
SKAP2-206ENST00000489977 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa4.71□□□□□ -1.66
SKAP2-206ENST00000489977 MMS19Q96T76 1030 aa4.71□□□□□ -1.66
SKAP2-206ENST00000489977 MAP3K14Q99558 947 aa4.71□□□□□ -1.66
SKAP2-206ENST00000489977 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
SKAP2-206ENST00000489977 C17orf80Q9BSJ5 609 aa4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms