RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

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Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 GALTP07902 379 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXB3-210ENST00000489475 PSMA2P25787 234 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXB3-210ENST00000489475 SSR1P43307 286 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
HOXB3-210ENST00000489475 OLFML1Q6UWY5 402 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXB3-210ENST00000489475 CLEC20AQ6ZU45 233 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXB3-210ENST00000489475 PIGZQ86VD9 579 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXB3-210ENST00000489475 TOP1MTQ969P6 601 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXB3-210ENST00000489475 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP28.21■■■□□ 2.11
HOXB3-210ENST00000489475 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
HOXB3-210ENST00000489475 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP28.21■■■□□ 2.117e-8■■■■■ 58.7
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HOXB3-210ENST00000489475 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.11
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HOXB3-210ENST00000489475 OAZ2O95190 189 aa28.2■■■□□ 2.11
HOXB3-210ENST00000489475 CDR1P51861 262 aa28.2■■■□□ 2.11
HOXB3-210ENST00000489475 BCAR1P56945 870 aa28.2■■■□□ 2.11
HOXB3-210ENST00000489475 SLC6A3Q01959 620 aa28.2■■■□□ 2.11
HOXB3-210ENST00000489475 RHOT1Q8IXI2 618 aa28.2■■■□□ 2.11
HOXB3-210ENST00000489475 EMC1Q8N766 993 aa28.2■■■□□ 2.11
HOXB3-210ENST00000489475 MYLPFQ96A32 169 aa28.2■■■□□ 2.11
HOXB3-210ENST00000489475 SMARCD1Q96GM5 515 aa28.2■■■□□ 2.11
HOXB3-210ENST00000489475 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.11
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HOXB3-210ENST00000489475 LCP1P13796 627 aa28.2■■■□□ 2.1
HOXB3-210ENST00000489475 MAP3K7CLP57077 242 aa28.2■■■□□ 2.1
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HOXB3-210ENST00000489475 FAM171A1Q5VUB5 890 aa28.2■■■□□ 2.1
HOXB3-210ENST00000489475 PKMYT1Q99640 499 aa28.2■■■□□ 2.1
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HOXB3-210ENST00000489475 PLVAPQ9BX97 442 aa28.19■■■□□ 2.1
HOXB3-210ENST00000489475 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa28.19■■■□□ 2.1
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM59LQ9UK28 342 aa28.19■■■□□ 2.1
HOXB3-210ENST00000489475 BEST1O76090 585 aa28.18■■■□□ 2.1
HOXB3-210ENST00000489475 ACRP10323 421 aa28.18■■■□□ 2.1
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HOXB3-210ENST00000489475 GPR62Q9BZJ7 368 aa28.18■■■□□ 2.1
HOXB3-210ENST00000489475 LRRC4Q9HBW1 653 aa28.18■■■□□ 2.1
HOXB3-210ENST00000489475 LTBP2Q14767 1821 aa28.18■■■□□ 2.1
HOXB3-210ENST00000489475 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa28.18■■■□□ 2.1
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HOXB3-210ENST00000489475 TAS2R40P59535 323 aa28.18■■■□□ 2.1
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HOXB3-210ENST00000489475 FUT10Q6P4F1 479 aa28.18■■■□□ 2.1
HOXB3-210ENST00000489475 IL23AQ9NPF7 189 aa28.18■■■□□ 2.1
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HOXB3-210ENST00000489475 LRRTM3Q86VH5 581 aa28.17■■■□□ 2.1
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HOXB3-210ENST00000489475 BDNFP23560 247 aa28.15■■■□□ 2.1
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HOXB3-210ENST00000489475 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
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HOXB3-210ENST00000489475 LONRF2Q1L5Z9 754 aa28.15■■■□□ 2.1
HOXB3-210ENST00000489475 CTXN3Q4LDR2 81 aa28.15■■■□□ 2.1
HOXB3-210ENST00000489475 FAM117BQ6P1L5 589 aa28.15■■■□□ 2.1
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HOXB3-210ENST00000489475 KCNK16Q96T55 309 aa28.15■■■□□ 2.1
HOXB3-210ENST00000489475 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa28.15■■■□□ 2.1
HOXB3-210ENST00000489475 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa28.15■■■□□ 2.1
HOXB3-210ENST00000489475 CWH43Q9H720 699 aa28.15■■■□□ 2.1
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