RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486016.1

GCFC2-209, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 3

Gene GCFC2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-209	ENST00000486016		Q4G0T1	1027 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	WAC	Q9BTA9	647 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	ARMT1	Q9H993	441 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	VNN1	O95497	513 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	PRKCB	P05771	671 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	VCAM1	P19320	739 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	MMP13	P45452	471 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	NEK2	P51955	445 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	RAB1A	P62820	205 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	PSG6	Q00889	435 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	RABEP1	Q15276	862 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	CCDC157	Q569K6	752 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	PRR25	Q96S07	402 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	CIPC	Q9C0C6	399 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	CPA4	Q9UI42	421 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	EXOC3	O60645	756 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	NPR1	P16066	1061 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	E2F1	Q01094	437 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	FGL2	Q14314	439 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	HMCES	Q96FZ2	354 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCFC2-209	ENST00000486016		H3BML4	177 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	USP1	O94782	785 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	FGA	P02671	866 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	PF4V1	P10720	104 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	CTBP1	Q13363	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	FHL1	Q13642	323 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	CNGA4	Q8IV77	575 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	HOOK2	Q96ED9	719 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	STAP2	Q9UGK3	403 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	AP4M1	O00189	453 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	OFD1	O75665	1012 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	A1BG	P04217	495 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	IL1R2	P27930	398 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	FAM187B	Q17R55	369 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	NRAC	Q8N912	160 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	UBXN7	O94888	489 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	HTR1B	P28222	390 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	LINC00205	P59089	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-209	ENST00000486016	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62

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