RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482844.5

CRBN-208, Transcript of cereblon, human

TSL 4

Gene CRBN, Length 653 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRBN-208	ENST00000482844	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	RITA1	Q96K30	269 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	AP4M1	O00189	453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	TSPAN6	O43657	245 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	OFD1	O75665	1012 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	TUBB4A	P04350	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	KRT17	Q04695	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	PPP2R5A	Q15172	486 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	RABEP1	Q15276	862 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	PMM1	Q92871	262 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	ASB2	Q96Q27	587 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	MYO1C	O00159	1063 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	KIT	P10721	976 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	VIPR2	P41587	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	MMP13	P45452	471 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	TPTE	P56180	551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	RAB1A	P62820	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	E2F1	Q01094	437 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	FGL2	Q14314	439 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	SMC5	Q8IY18	1101 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	MYO1F	O00160	1098 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	NPR1	P16066	1061 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	HTR1B	P28222	390 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	PDE6C	P51160	858 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	RHBDL3	P58872	404 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	MCL1	Q07820	350 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	CTBP1	Q13363	440 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	BIRC2	Q13490	618 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	CYP1B1	Q16678	543 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	TPH2	Q8IWU9	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	TERB1	Q8NA31	727 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	CIPC	Q9C0C6	399 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	VPS16	Q9H269	839 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	MED16	Q9Y2X0	877 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	PLIN1	O60240	522 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	CAND2	O75155	1236 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	MOSPD3	O75425	235 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	ABLIM3	O94929	683 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	KCNA3	P22001	575 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	GNAL	P38405	381 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	RENBP	P51606	427 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	DGKE	P52429	567 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	PRKAG1	P54619	331 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	FHL1	Q13642	323 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844		Q4G0T1	1027 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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