RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 DEPTORQ8TB45 409 aa8.51□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 HSPA12BQ96MM6 686 aa8.51□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.51□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 LRRC3Q9BY71 257 aa8.51□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.51□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 ECT2Q9H8V3 914 aa8.51□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa8.51□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 KIF3AQ9Y496 699 aa8.51□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa8.51□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 ABCA12Q86UK0 2595 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 CLEC18AA5D8T8 446 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 PP2D1A8MPX8 630 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 ACKR2O00590 384 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 PODXLO00592 558 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 BRINP1O60477 761 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 OBSL1O75147 1896 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 BAG4O95429 457 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 OR4Q2P0C623 313 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 HARSP12081 509 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 CYP11B2P19099 503 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 GABRR2P28476 465 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 CDC25CP30307 473 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 NAMPTP43490 491 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 AFMP43652 599 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 VASPP50552 380 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 CDR1P51861 262 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 MAPK7Q13164 816 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 CTXN3Q4LDR2 81 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 SEZ6Q53EL9 994 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 ATF7IP2Q5U623 682 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 CLEC18BQ6UXF7 455 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM92Q6UXU6 159 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 ERICH1Q86X53 443 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 CMTM8Q8IZV2 173 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 DAW1Q8N136 415 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 DEFB119Q8N690 84 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 TTC9BQ8N6N2 239 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 CLEC18CQ8NCF0 446 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 HMGB4Q8WW32 186 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 ATP2A3Q93084 1043 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 STARD5Q9NSY2 213 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 FBXL5Q9UKA1 691 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 PTPRDP23468 1912 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 BLACEA4D250 179 aa8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 ARHGEF35A5YM69 484 aa8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 K7ENP7 123 aa8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 SOAT2O75908 522 aa8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 OR52Z1P0C646 297 aa8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 CPB1P15086 417 aa8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 TLE1Q04724 770 aa8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 MYO1EQ12965 1108 aa8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 HLA-BQ31612 363 aa8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF568Q3ZCX4 644 aa8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 TRIM68Q6AZZ1 485 aa8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF280DQ6N043 979 aa8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 KCNK18Q7Z418 384 aa8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 KCNE4Q8WWG9 221 aa8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 TSC1Q92574 1164 aa8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 SEMA3CQ99985 751 aa8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 RUSC1Q9BVN2 902 aa8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 C2orf40Q9H1Z8 148 aa8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 BHMT2Q9H2M3 363 aa8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 PTPRHQ9HD43 1115 aa8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 TUFT1Q9NNX1 390 aa8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 TDP1Q9NUW8 608 aa8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 FTSJ1Q9UET6 329 aa8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 YIPF1Q9Y548 306 aa8.49□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 MYMKA6NI61 221 aa8.48□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 K7EQS6 105 aa8.48□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 PPEF2O14830 753 aa8.48□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 KLK10O43240 276 aa8.48□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 PRAMEF12O95522 483 aa8.48□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 TPM3P06753 285 aa8.48□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 ARSAP15289 507 aa8.48□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 XBP1P17861 261 aa8.48□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 NDUFV2P19404 249 aa8.48□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.052e-6■■□□□ 11.5
SZRD1-208ENST00000476423 GRM5P41594 1212 aa8.48□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 IFNAR2P48551 515 aa8.48□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 GUCY2FP51841 1108 aa8.48□□□□□ -1.05
SZRD1-208ENST00000476423 SEC13P55735 322 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms