RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464518.1

SLC13A3-208, Transcript of solute carrier family 13 member 3, human

TSL 5

Gene SLC13A3, Length 792 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZZEF1	O43149	2961 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	SCN1A	P35498	2009 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	MYMK	A6NI61	221 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	PP2D1	A8MPX8	630 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	PLA2G4B	P0C869	781 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	MAPK8	P45983	427 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	PPP3CC	P48454	512 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	MYL7	Q01449	175 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	ST3GAL1	Q11201	340 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	PARVG	Q9HBI0	331 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	CAPN10	Q9HC96	672 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518		K7ENM7	598 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	TRAK2	O60296	914 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	IL18RAP	O95256	599 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	SYP	P08247	313 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	PTGER3	P43115	390 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	MAGEA11	P43364	429 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	TNFRSF4	P43489	277 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	GPR15	P49685	360 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	GTF2B	Q00403	316 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	GAB4	Q2WGN9	574 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	PDZD3	Q86UT5	571 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	SPATA17	Q96L03	361 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	SLC22A12	Q96S37	553 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	PNKP	Q96T60	521 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	PKMYT1	Q99640	499 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518		A0A1W2PQD8	194 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	HUS1	O60921	280 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	APOD	P05090	189 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	CYP17A1	P05093	508 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	CFI	P05156	583 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	HDC	P19113	662 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	PCSK1	P29120	753 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	LHX1	P48742	406 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	SEC13	P55735	322 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	SLC7A9	P82251	487 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	IL17A	Q16552	155 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	DDR2	Q16832	855 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	ARSH	Q5FYA8	562 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	VSTM1	Q6UX27	236 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	COL26A1	Q96A83	441 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	AK8	Q96MA6	479 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	REEP2	Q9BRK0	252 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	DKK4	Q9UBT3	224 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	C2orf78	A6NCI8	922 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	ARHGAP33	O14559	1287 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZNF217	O75362	1048 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	KAT7	O95251	611 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	OLFM2	O95897	454 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	ADH1C	P00326	375 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SLC13A3-208	ENST00000464518	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24	3e-7	■□□□□ 8.6

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