RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	DUSP26	Q9BV47	211 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	CERS4	Q9HA82	394 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLK1-208	ENST00000464454	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	WDR27	A2RRH5	827 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	APOL1	O14791	398 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	CCP110	O43303	1012 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	NCK2	O43639	380 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	FGF18	O76093	207 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	MT-ND5	P03915	603 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	RARRES1	P49788	294 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	PDE6C	P51160	858 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	MAPK10	P53779	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	INHBE	P58166	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	BMPR2	Q13873	1038 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	INSC	Q1MX18	579 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	PRR16	Q569H4	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	IQCD	Q96DY2	449 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	SNX22	Q96L94	193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	INSL6	Q9Y581	213 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ADM5	C9JUS6	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	PPM1D	O15297	605 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	THAP12	O43422	761 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	RASSF9	O75901	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	INMT	O95050	263 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ONECUT2	O95948	504 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	RHO	P08100	348 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	DGKE	P52429	567 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	COL10A1	Q03692	680 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	STK3	Q13188	491 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	TBCC	Q15814	346 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	RNF44	Q7L0R7	432 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	BEND5	Q7L4P6	421 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454		A0A1W2PPC4	97 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ZAR1L	A6NP61	321 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	TTLL1	O95922	423 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ABCB4	P21439	1286 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	FGFR2	P21802	821 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	PPM1A	P35813	382 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ALDH9A1	P49189	494 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	CACNA2D1	P54289	1103 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	PRKAG1	P54619	331 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	YAF2	Q8IY57	180 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	GPR150	Q8NGU9	434 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	OR56A3	Q8NH54	315 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	KIAA1191	Q96A73	305 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CLK1-208	ENST00000464454	CHST8	Q9H2A9	424 aa		4.94	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms